224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1702 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  100 
 
 
184 aa  362  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  88.04 
 
 
184 aa  322  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  83.15 
 
 
184 aa  305  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  78.26 
 
 
184 aa  286  9e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  48 
 
 
213 aa  156  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  48.09 
 
 
185 aa  148  4e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  40.11 
 
 
193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  40.12 
 
 
191 aa  139  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  38.89 
 
 
191 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  39.78 
 
 
187 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  32.22 
 
 
185 aa  110  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
193 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  33.93 
 
 
192 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  30.11 
 
 
200 aa  102  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  34.09 
 
 
178 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4017  protein of unknown function DUF820  32.58 
 
 
182 aa  98.6  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.389998 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  29.35 
 
 
192 aa  97.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  29.19 
 
 
194 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  30.39 
 
 
192 aa  95.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  29.11 
 
 
192 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
195 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  28.33 
 
 
195 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  31.74 
 
 
192 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
193 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  25.62 
 
 
208 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  28.65 
 
 
194 aa  92  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
187 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  31.61 
 
 
187 aa  92  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  28.96 
 
 
200 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  30.39 
 
 
185 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
192 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4048  hypothetical protein  44.44 
 
 
123 aa  88.6  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726239  normal  0.0346134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  27.57 
 
 
184 aa  87.8  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  29.89 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  29.3 
 
 
195 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0643  hypothetical protein  31.02 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.263684  normal  0.384652 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  25.97 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  30.12 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  27.78 
 
 
185 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
191 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
191 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
191 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  30.92 
 
 
190 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 
189 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  28.31 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  28.18 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0341  protein of unknown function DUF820  30 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000000574884  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
191 aa  81.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  27.44 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  27.03 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  27.72 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1060  hypothetical protein  31.38 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000122836  decreased coverage  0.00000222645 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  31.14 
 
 
199 aa  79  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
200 aa  77.8  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2985  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 
193 aa  77  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  32.53 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0572  protein of unknown function DUF820  23.89 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  27.17 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1596  protein of unknown function DUF820  27.85 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.550261 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0468  protein of unknown function DUF820  28.48 
 
 
191 aa  74.3  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0619139  normal  0.13059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  29.31 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
189 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  26.35 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3326  hypothetical protein  24.68 
 
 
191 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.206269  normal  0.138444 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  26.44 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  28.85 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0099  protein of unknown function DUF820  31.71 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.52 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  29.79 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  36.51 
 
 
189 aa  67.8  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  26.79 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  34.44 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1357  hypothetical protein  24.24 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5396  protein of unknown function DUF820  34.58 
 
 
190 aa  65.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3773  hypothetical protein  27.39 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.211833  normal  0.137828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  26.88 
 
 
192 aa  65.9  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  30.28 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2174  protein of unknown function DUF820  25.47 
 
 
181 aa  65.1  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0729554 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  26.95 
 
 
245 aa  64.7  0.0000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  30.59 
 
 
189 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  24.14 
 
 
241 aa  63.2  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  23.86 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  25.77 
 
 
251 aa  62.4  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  31.68 
 
 
195 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
184 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  24.62 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  36.17 
 
 
197 aa  61.6  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  61.6  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>