More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1700 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
312 aa  635    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  90.71 
 
 
312 aa  547  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  73.22 
 
 
320 aa  448  1e-125  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  57 
 
 
315 aa  356  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 
334 aa  210  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  41.75 
 
 
318 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  35.16 
 
 
320 aa  179  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  35.47 
 
 
313 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
337 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  36.18 
 
 
328 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  35.41 
 
 
320 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  37.25 
 
 
331 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
353 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  33.08 
 
 
337 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  29.74 
 
 
339 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 
286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  29.41 
 
 
339 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.25 
 
 
298 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
332 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  38.94 
 
 
290 aa  125  9e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  32.45 
 
 
314 aa  123  5e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  32.89 
 
 
283 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  34.16 
 
 
336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  31.17 
 
 
348 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  33.46 
 
 
841 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  28.25 
 
 
335 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  34.85 
 
 
335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  31.45 
 
 
291 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
341 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  30.36 
 
 
294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.72 
 
 
358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  27.81 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4006  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 
342 aa  113  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2402  hypothetical protein  34.15 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  34.07 
 
 
401 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  27.13 
 
 
350 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  34.67 
 
 
279 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  26.92 
 
 
330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  29.08 
 
 
307 aa  110  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 
321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  32.22 
 
 
303 aa  109  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
1340 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
330 aa  108  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 
339 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.5 
 
 
841 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  36.55 
 
 
308 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  31.73 
 
 
308 aa  106  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  27.27 
 
 
338 aa  106  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  26.07 
 
 
336 aa  105  1e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.19 
 
 
282 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  31.46 
 
 
300 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.93 
 
 
322 aa  101  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.12 
 
 
838 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
298 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  33.78 
 
 
313 aa  99.4  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  29.39 
 
 
366 aa  98.6  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  29.19 
 
 
340 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
376 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
311 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
358 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
836 aa  97.8  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
822 aa  97.8  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  28.82 
 
 
722 aa  95.9  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  32.05 
 
 
785 aa  95.9  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.99 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
300 aa  94.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
525 aa  94.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.21 
 
 
378 aa  94.7  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.18 
 
 
2401 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
299 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.2 
 
 
346 aa  93.6  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0148  glycosyl transferase family protein  29.96 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.341853  normal  0.155279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 
679 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
300 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
329 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
293 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  31.16 
 
 
305 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  28.14 
 
 
333 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.02 
 
 
305 aa  90.5  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
324 aa  89.4  7e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  31.02 
 
 
321 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.8 
 
 
652 aa  89.4  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  32.48 
 
 
337 aa  89  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
325 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  31.06 
 
 
705 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
297 aa  87  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
1739 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2705  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
334 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00520476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.3 
 
 
308 aa  87  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>