More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1692 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  88.05 
 
 		 478 aa  848    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  100 
 
 		 479 aa  962    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  61.91 
 
 		 471 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  63.69 
 
 		 474 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  52.43 
 
 		 509 aa  472  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  53.6 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4409  pyruvate kinase  52.1 
 
 		 480 aa  463  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000010448  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1613  pyruvate kinase  52.19 
 
 		 480 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0729902  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  51.69 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1850  pyruvate kinase  51.69 
 
 		 474 aa  455  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.117078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 583 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  50.43 
 
 		 583 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  50.53 
 
 		 476 aa  448  1e-125  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  49.58 
 
 		 585 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0098  pyruvate kinase  50.62 
 
 		 594 aa  445  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  51.37 
 
 		 491 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  50.11 
 
 		 584 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3331  pyruvate kinase  52.54 
 
 		 480 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.616475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 585 aa  442  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2254  pyruvate kinase  49.04 
 
 		 472 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1182  pyruvate kinase  51.15 
 
 		 481 aa  445  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 585 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  48.85 
 
 		 585 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  50.53 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3093  pyruvate kinase  50 
 
 		 481 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 596 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1701  pyruvate kinase  52.78 
 
 		 478 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  48.85 
 
 		 585 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2305  pyruvate kinase  48.83 
 
 		 472 aa  440  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.810817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4428  pyruvate kinase  51.36 
 
 		 471 aa  439  9.999999999999999e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.132665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  49.15 
 
 		 585 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  48.02 
 
 		 585 aa  438  9.999999999999999e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 596 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 472 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 580 aa  435  1e-121  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  49.16 
 
 		 597 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  48.3 
 
 		 578 aa  438  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 585 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  47.77 
 
 		 583 aa  433  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  49.89 
 
 		 474 aa  433  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4234  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 489 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  49.58 
 
 		 596 aa  433  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  48.42 
 
 		 585 aa  431  1e-119  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  51.49 
 
 		 474 aa  430  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  47.79 
 
 		 476 aa  431  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1796  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 581 aa  431  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2208  pyruvate kinase  48.43 
 
 		 590 aa  430  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  48.41 
 
 		 482 aa  431  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 585 aa  429  1e-119  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  48.2 
 
 		 482 aa  429  1e-119  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  50.64 
 
 		 474 aa  426  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  49.47 
 
 		 587 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  49.48 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  48.52 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  49.16 
 
 		 496 aa  426  1e-118  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3905  pyruvate kinase  49.8 
 
 		 600 aa  427  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.252836 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  45.8 
 
 		 590 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4367  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 489 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  48.63 
 
 		 485 aa  423  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1694  pyruvate kinase  47.71 
 
 		 589 aa  423  1e-117  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1436  pyruvate kinase  48.64 
 
 		 494 aa  422  1e-117  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.952527  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  49.04 
 
 		 577 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4390  pyruvate kinase  48.94 
 
 		 489 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.474716  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0440  pyruvate kinase  50.64 
 
 		 586 aa  425  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  50.21 
 
 		 476 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  48.33 
 
 		 580 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  48.95 
 
 		 485 aa  422  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  50.42 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  48.09 
 
 		 582 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0833  pyruvate kinase  48.23 
 
 		 479 aa  421  1e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.117468  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1688  pyruvate kinase  49.79 
 
 		 496 aa  419  1e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000849836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2926  pyruvate kinase  48.16 
 
 		 587 aa  418  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.255815 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  49.68 
 
 		 474 aa  419  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  48.95 
 
 		 585 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3020  pyruvate kinase  47.68 
 
 		 487 aa  419  1e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111812  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11020  pyruvate kinase  48.52 
 
 		 495 aa  419  1e-116  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.887694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  45.88 
 
 		 580 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  49.06 
 
 		 483 aa  418  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3211  pyruvate kinase  48.19 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  46.62 
 
 		 582 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2959  pyruvate kinase  49.37 
 
 		 505 aa  418  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.970052 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2983  pyruvate kinase  48.95 
 
 		 483 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  48.96 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  48.96 
 
 		 592 aa  415  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1080  pyruvate kinase  49.26 
 
 		 481 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.856635 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1221  pyruvate kinase  48.73 
 
 		 472 aa  411  1e-113  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.724591  normal  0.678636 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  45.57 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2211  pyruvate kinase  46.09 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0824427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5699  pyruvate kinase  47.23 
 
 		 493 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1115  pyruvate kinase  50 
 
 		 490 aa  408  1.0000000000000001e-112  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000141137  hitchhiker  0.0000000000000541512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1678  pyruvate kinase  47.57 
 
 		 471 aa  408  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0855403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0833  pyruvate kinase  44.09 
 
 		 582 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.964411  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  47.57 
 
 		 472 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24770  pyruvate kinase  47.47 
 
 		 474 aa  408  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>