12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1688 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1688  TadE family protein  100 
 
 		 175 aa  356  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.598074  hitchhiker  0.000000154995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1267  TadE family protein  93.14 
 
 		 175 aa  318  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0054  TadE family protein  40.22 
 
 		 192 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.264779  normal  0.374469 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3944  TadE family protein  34.76 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000125282  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1023  TadE family protein  31.33 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2732  TadE family protein  34.51 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0797  TadE-like  30.16 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160626  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2320  TadE family protein  29.32 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3347  TadE family protein  39.47 
 
 		 140 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2356  TadE-like  43.75 
 
 		 145 aa  42  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0055  TadE family protein  44 
 
 		 197 aa  42  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.258579  normal  0.372833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1520  TadE-like  37.5 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>