More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1683 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1273  response regulator receiver protein  92.09 
 
 		 430 aa  795    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.804052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  100 
 
 		 430 aa  867    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3209  response regulator receiver protein  63.79 
 
 		 416 aa  522  1e-147  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.5486  normal  0.724042 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4612  response regulator receiver protein  62.02 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.936503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2115  response regulator receiver protein  37.68 
 
 		 412 aa  290  4e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2317  response regulator receiver protein  35.82 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.594065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1020  response regulator receiver protein  33.58 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  38.4 
 
 		 391 aa  215  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0842  response regulator receiver protein  33.42 
 
 		 390 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.884409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0422  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 444 aa  195  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.183813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4620  response regulator receiver protein  31.27 
 
 		 416 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.405994  normal  0.099888 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4154  response regulator receiver protein  29.95 
 
 		 419 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.268722 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3115  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  34.16 
 
 		 395 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.523841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1834  response regulator receiver protein  28.42 
 
 		 376 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3353  response regulator receiver protein  28.79 
 
 		 419 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2647  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.45 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0798  response regulator receiver domain-containing protein  32.38 
 
 		 391 aa  156  8e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2554  response regulator receiver domain-containing protein  30.5 
 
 		 387 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.494037  normal  0.119042 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0975  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.93 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0679592  normal  0.79779 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2932  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.29 
 
 		 398 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1853  AAA ATPase  32.99 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0455079  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2638  putative flp pilus assembly protein CpaE  28.34 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2701  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2355  response regulator receiver domain-containing protein  25.45 
 
 		 412 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0793  response regulator receiver  27.27 
 
 		 406 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1056  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 373 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3205  response regulator receiver protein  29.6 
 
 		 373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.111806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1497  response regulator receiver protein  27.94 
 
 		 389 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1527  response regulator receiver protein  26.74 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1751  Flp pilus assembly ATPase CpaE  26.48 
 
 		 392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2826  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.05 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4616  putative pilus assembly protein CpaE  30.84 
 
 		 400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.984834  normal  0.399314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2924  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  28.62 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0388199  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5415  putative pilus assembly protein CpaE  28.69 
 
 		 400 aa  126  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.677739 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3008  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  30.41 
 
 		 389 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1162  response regulator receiver protein  28.4 
 
 		 389 aa  123  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1187  putative pilus assembly protein CpaE  28.34 
 
 		 400 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.424023 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2914  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  29.21 
 
 		 377 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5323  response regulator receiver protein  27.65 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00097101  decreased coverage  0.00042828 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4443  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.14 
 
 		 391 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0191569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0546  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 397 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.257068  normal  0.881145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0303  chromosome partitioning ATPase  27.54 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0642  response regulator receiver domain-containing protein  27.13 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133879  normal  0.446535 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.86 
 
 		 224 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.75 
 
 		 209 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0528  two component LuxR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 201 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.653057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2362  response regulator receiver domain-containing protein  25.89 
 
 		 413 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.382482  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0118  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.22 
 
 		 205 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137239  normal  0.184056 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0555  response regulator receiver protein  25.39 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1907  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaE  26.48 
 
 		 423 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.37678  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2272  putative septum site-determining protein  28.3 
 
 		 537 aa  103  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1588  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 201 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.117504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2646  response regulator receiver protein  27.2 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03860  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.15 
 
 		 204 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0649288  normal  0.281143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.15 
 
 		 211 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 216 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3006  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.38 
 
 		 204 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248543  hitchhiker  0.000146029 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7161  two component LuxR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 225 aa  99  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0588186  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3423  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  28.51 
 
 		 407 aa  99  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664271  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1315  flp pilus assembly protein, ATPase  26.59 
 
 		 402 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 216 aa  99.8  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1680  response regulator receiver protein  44.53 
 
 		 197 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.516841 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0896  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 216 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2965  response regulator  26.22 
 
 		 402 aa  98.6  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.206584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3090  response regulator  26.59 
 
 		 402 aa  99  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2273  putative pilus assembly protein CpaE  25.82 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.865056  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 212 aa  97.8  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 239 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1726  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like  29.19 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 237 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3967  Flp pilus assembly protein ATPase CpaE-like protein  26.33 
 
 		 382 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.467038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1110  response regulator receiver protein  25.51 
 
 		 404 aa  96.7  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.129352  normal  0.0915857 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 216 aa  96.3  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  45.04 
 
 		 234 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  47.46 
 
 		 234 aa  95.9  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1127  response regulator receiver protein  24.58 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0288  LuxR response regulator receiver  42.02 
 
 		 201 aa  95.5  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0935286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 237 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 217 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0451  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 216 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2348  response regulator receiver protein  24.27 
 
 		 414 aa  96.3  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.795034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.84 
 
 		 216 aa  96.3  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  46.15 
 
 		 226 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  42.02 
 
 		 212 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0467  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 216 aa  94.7  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000507383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.83 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  35 
 
 		 222 aa  94.4  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1039  two component LuxR family transcriptional regulator  43.44 
 
 		 238 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.135118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 217 aa  94.4  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 233 aa  94.7  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1197  two component LuxR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 225 aa  94.4  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0485473 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21850  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.86 
 
 		 222 aa  94.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118113  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5066  LuxR response regulator receiver  42.24 
 
 		 217 aa  93.6  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.822528  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  41.88 
 
 		 216 aa  93.2  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 222 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0589  response regulator receiver protein  22.67 
 
 		 402 aa  93.2  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.32054  normal  0.148759 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 214 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0980  nitrate/nitrite response regulator transcription regulator protein  40.87 
 
 		 222 aa  93.2  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2782  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 214 aa  93.2  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.834695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>