59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1636 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1636  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  156  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0516915  decreased coverage  0.000426709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2492  hypothetical protein  88.46 
 
 		 87 aa  137  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000948417  normal  0.130389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2207  protein of unknown function DUF433  45.45 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000283709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0429  protein of unknown function DUF433  47.76 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0264  protein of unknown function DUF433  46.15 
 
 		 79 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.281649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1814  hypothetical protein  55.32 
 
 		 52 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.176447  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2054  protein of unknown function DUF433  41.1 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2505  hypothetical protein  43.55 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1773  protein of unknown function DUF433  42.86 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1682  hypothetical protein  42.19 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00134112  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1160  hypothetical protein  44.26 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.295531  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0601  hypothetical protein  46.67 
 
 		 79 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.259167  normal  0.179543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4279  protein of unknown function DUF433  39.71 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2493  hypothetical protein  39.73 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.249953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4630  protein of unknown function DUF433  41.67 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.569731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2090  protein of unknown function DUF433  46.67 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4191  hypothetical protein  40.68 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1377  hypothetical protein  38.96 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0538  hypothetical protein  42.86 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0896  hypothetical protein  41.54 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000110923 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4167  hypothetical protein  39.47 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338613  decreased coverage  0.00000145302 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3038  hypothetical protein  43.33 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.58349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3242  protein of unknown function DUF433  39.71 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2876  protein of unknown function DUF433  39.71 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0127406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4513  protein of unknown function DUF433  40 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2185  hypothetical protein  40.91 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1708  protein of unknown function DUF433  40.91 
 
 		 74 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2195  hypothetical protein  40.91 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2222  hypothetical protein  40.91 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00122124  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2485  hypothetical protein  36.49 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.374891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0169  hypothetical protein  32.86 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2182  protein of unknown function DUF433  40 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0840414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1238  hypothetical protein  43.28 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0524363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0894  protein of unknown function DUF433  42.11 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2516  protein of unknown function DUF433  39.06 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0559942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3434  protein of unknown function DUF433  38.6 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1355  protein of unknown function DUF433  40.68 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0014306  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0500  protein of unknown function DUF433  36.84 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0439  hypothetical protein  40 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5088  protein of unknown function DUF433  37.68 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000523487  normal  0.135108 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4619  protein of unknown function DUF433  45.1 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2499  hypothetical protein  41.38 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.322714  normal  0.339788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1799  protein of unknown function DUF433  40.68 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.69777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3160  protein of unknown function DUF433  39.06 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.419433  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4899  hypothetical protein  34.25 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0636447  normal  0.113291 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2643  hypothetical protein  39.34 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0057  protein of unknown function DUF433  36.36 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1913  protein of unknown function DUF433  40.68 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0274585  normal  0.840048 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1888  protein of unknown function DUF433  40.68 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2760  hypothetical protein  40.38 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.986654  normal  0.252993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0082  hypothetical protein  36.84 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.024664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2639  protein of unknown function DUF433  41.67 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0907931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3854  protein of unknown function DUF433  40 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.949031 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2261  hypothetical protein  36.67 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000450258 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1741  hypothetical protein  40.35 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0110303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2776  hypothetical protein  37.1 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1312  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0533  hypothetical protein  38.33 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5015  hypothetical protein  35.59 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.819476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>