163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1608 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0239  hypothetical protein  57.41 
 
 		 1106 aa  899    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00821808 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1608  hypothetical protein  100 
 
 		 1279 aa  2595    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2009  hypothetical protein  30.98 
 
 		 996 aa  295  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.785597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4275  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1001 aa  292  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3988  hypothetical protein  31.05 
 
 		 982 aa  283  2e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.172712 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3987  hypothetical protein  31.35 
 
 		 967 aa  270  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.375617 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2145  protein of unknown function DUF1156  33.75 
 
 		 937 aa  239  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000164543  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0506  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1003 aa  239  3e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.967914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1235  protein of unknown function DUF1156  33.2 
 
 		 951 aa  233  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3117  hypothetical protein  25.07 
 
 		 936 aa  228  7e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4236  hypothetical protein  24.83 
 
 		 934 aa  226  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.4305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0655  hypothetical protein  30.73 
 
 		 969 aa  225  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1594  hypothetical protein  29.71 
 
 		 920 aa  221  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0199  protein of unknown function DUF1156  31.91 
 
 		 969 aa  213  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676396  normal  0.41687 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0638  protein of unknown function DUF1156  31.25 
 
 		 906 aa  213  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00295664  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2496  protein of unknown function DUF1156  33.65 
 
 		 962 aa  211  6e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2630  hypothetical protein  33.41 
 
 		 561 aa  211  7e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.100326  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2991  hypothetical protein  30.2 
 
 		 933 aa  211  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0317555  normal  0.296182 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3008  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1012 aa  209  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0198  hypothetical protein  29.4 
 
 		 933 aa  208  5e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.213354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1018  protein of unknown function DUF1156  31.33 
 
 		 968 aa  207  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.174443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0682  hypothetical protein  28.99 
 
 		 848 aa  206  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1848  hypothetical protein  28.92 
 
 		 968 aa  206  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2190  hypothetical protein  29.59 
 
 		 792 aa  204  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1753  hypothetical protein  29.42 
 
 		 960 aa  198  5.000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2103  protein of unknown function DUF1156  30.81 
 
 		 961 aa  188  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2719  hypothetical protein  28.6 
 
 		 965 aa  183  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000742651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0635  hypothetical protein  30.3 
 
 		 972 aa  183  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4967  protein of unknown function DUF1156  36.08 
 
 		 745 aa  165  6e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.241084 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5492  adenine-specific DNA methylase  27.46 
 
 		 911 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.219644  normal  0.117593 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5892  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  27.46 
 
 		 911 aa  158  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1772  adenine-specific DNA methylase  23.47 
 
 		 916 aa  154  7e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0719  hypothetical protein  31.77 
 
 		 947 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000148143 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1808  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1008 aa  133  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0837285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0382  protein of unknown function DUF1156  29.49 
 
 		 894 aa  133  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.41417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1959  hypothetical protein  57.02 
 
 		 121 aa  133  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00461889  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3347  adenine-specific DNA methylase  23.7 
 
 		 878 aa  129  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3562  adenine-specific DNA methylase  29.18 
 
 		 455 aa  129  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0099  hypothetical protein  24.78 
 
 		 1071 aa  125  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.658498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1395  hypothetical protein  44.94 
 
 		 194 aa  121  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0982  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1001 aa  118  6.9999999999999995e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2761  adenine-specific DNA methylase  23.8 
 
 		 892 aa  115  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2132  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1118 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2684  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1045 aa  110  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2461  type I site-specific deoxyribonuclease, HsdR family  30.7 
 
 		 1403 aa  106  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3209  protein of unknown function DUF559  46.53 
 
 		 122 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0254559 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1791  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  29.62 
 
 		 703 aa  103  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3100  hypothetical protein  22.36 
 
 		 1070 aa  103  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1705  hypothetical protein  36.17 
 
 		 1421 aa  102  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0550  DNA methyltransferase  34.47 
 
 		 1192 aa  102  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0608509  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  31.23 
 
 		 1712 aa  101  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2281  adenine-specific DNA methylase  26.19 
 
 		 751 aa  99.8  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0186187  hitchhiker  0.00483181 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0163  hypothetical protein  40.82 
 
 		 194 aa  97.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2279  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  24.41 
 
 		 651 aa  97.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.132856  hitchhiker  0.000043664 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 849 aa  95.9  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2274  protein of unknown function DUF559  43.56 
 
 		 122 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0690835  hitchhiker  0.00000422818 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2211  protein of unknown function DUF559  43.56 
 
 		 122 aa  95.5  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1367  hypothetical protein  23.67 
 
 		 746 aa  95.1  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1188  hypothetical protein  42.74 
 
 		 124 aa  94.7  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3097  adenine-specific DNA methylase containing a Zn-ribbon-like protein  26.25 
 
 		 737 aa  94.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.622238  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1948  hypothetical protein  37.59 
 
 		 731 aa  92.8  4e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2196  adenine-specific DNA methylase  27.2 
 
 		 747 aa  91.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2722  hypothetical protein  44.14 
 
 		 147 aa  90.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3620  protein of unknown function DUF559  42.5 
 
 		 142 aa  90.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1569  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  89.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0914412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1700  hypothetical protein  41.59 
 
 		 123 aa  89.4  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.768881  normal  0.131278 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5447  protein of unknown function DUF559  42.73 
 
 		 137 aa  89.4  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0571  hypothetical protein  53.52 
 
 		 133 aa  88.6  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.210516  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1674  protein of unknown function DUF559  40.5 
 
 		 133 aa  88.2  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2348  hypothetical protein  40.94 
 
 		 141 aa  87.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0673  hypothetical protein  40.25 
 
 		 173 aa  87.8  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.3274 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3917  hypothetical protein  41.82 
 
 		 154 aa  87  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0131192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0541  hypothetical protein  38.46 
 
 		 225 aa  86.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.164679  normal  0.146689 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3609  hypothetical protein  36.28 
 
 		 201 aa  86.7  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.239567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0164  protein of unknown function DUF559  38.94 
 
 		 119 aa  85.9  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 1146 aa  85.1  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0433  hypothetical protein  40.16 
 
 		 132 aa  84.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0037  protein of unknown function DUF559  37.9 
 
 		 159 aa  84  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1236  hypothetical protein  34.57 
 
 		 175 aa  83.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.453512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2097  hypothetical protein  47.25 
 
 		 118 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1559  hypothetical protein  43.1 
 
 		 121 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.999066 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1572  hypothetical protein  36.59 
 
 		 161 aa  80.5  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.62267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1553  hypothetical protein  38.79 
 
 		 117 aa  80.1  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.672305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4935  protein of unknown function DUF559  42.59 
 
 		 122 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0533861  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0011  protein of unknown function DUF559  38.83 
 
 		 123 aa  79.7  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1037  hypothetical protein  42.11 
 
 		 120 aa  79.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.252748 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2356  hypothetical protein  42.16 
 
 		 142 aa  79  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0831458  normal  0.14274 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0022  protein of unknown function DUF559  41.41 
 
 		 123 aa  78.6  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0213  hypothetical protein  38.6 
 
 		 139 aa  78.6  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.278517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1229  hypothetical protein  36.99 
 
 		 159 aa  78.2  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1094  hypothetical protein  36.8 
 
 		 144 aa  77.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.090836  normal  0.542302 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0046  hypothetical protein  40.83 
 
 		 163 aa  77.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1353  putative DNA methylase containing a Zn-ribbon  23.26 
 
 		 995 aa  77  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1403  hypothetical protein  35.71 
 
 		 148 aa  77  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0860159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0683  hypothetical protein  38.32 
 
 		 116 aa  76.3  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3525  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  76.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.739621  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1774  hypothetical protein  38.68 
 
 		 146 aa  76.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1525  hypothetical protein  37.14 
 
 		 111 aa  75.9  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2357  protein of unknown function DUF559  36.11 
 
 		 117 aa  75.1  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218447  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0562  hypothetical protein  39.64 
 
 		 111 aa  75.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>