More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1598 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.79 
 
 		 1240 aa  1310    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.219767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23930  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.76 
 
 		 1162 aa  1114    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.15 
 
 		 1177 aa  1159    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0603  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  54.42 
 
 		 1272 aa  1335    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03810  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.52 
 
 		 1178 aa  756    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000134486  normal  0.250195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0133  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.45 
 
 		 1177 aa  831    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000446144  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2421  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.23 
 
 		 1167 aa  685    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.142717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0183  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.47 
 
 		 1183 aa  1098    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0702536  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16761  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.58 
 
 		 1097 aa  1062    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.45 
 
 		 1177 aa  831    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.907147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4325  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.4 
 
 		 1143 aa  804    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.716075  normal  0.0767673 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0477  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.13 
 
 		 1263 aa  817    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0160  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.76 
 
 		 1191 aa  789    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1265  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  96.34 
 
 		 1229 aa  2398    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0997  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.44 
 
 		 1172 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04361  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.12 
 
 		 1097 aa  1009    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.29 
 
 		 1177 aa  830    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0098  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.45 
 
 		 1177 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.54 
 
 		 1284 aa  687    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0096  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.45 
 
 		 1177 aa  831    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0446  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  62.06 
 
 		 1235 aa  783    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0123  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.54 
 
 		 1177 aa  1169    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0114  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.45 
 
 		 1130 aa  830    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.65239e-57 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2654  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.99 
 
 		 1155 aa  1171    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.679256  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.7 
 
 		 1095 aa  1067    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0988562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3933  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.01 
 
 		 1143 aa  808    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.854688  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0103  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.16 
 
 		 1185 aa  1142    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000686573  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.83 
 
 		 1117 aa  750    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0502  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.2 
 
 		 1172 aa  715    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.145308  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0741  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.92 
 
 		 1096 aa  1090    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16071  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.97 
 
 		 1096 aa  748    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.614693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3155  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.03 
 
 		 1169 aa  798    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.268483 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0579  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.89 
 
 		 1183 aa  1082    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0605  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.33 
 
 		 1097 aa  998    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  59.74 
 
 		 1097 aa  740    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.883429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0391  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  60.95 
 
 		 1181 aa  787    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6627  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.84 
 
 		 1160 aa  1144    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357912  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0102  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.29 
 
 		 1177 aa  830    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1578  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.61 
 
 		 1097 aa  1056    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.702205  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1522  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.72 
 
 		 1100 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.18343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0070  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.36 
 
 		 1287 aa  704    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10681  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  50.55 
 
 		 1178 aa  1154    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2468  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  57.87 
 
 		 1141 aa  1273    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716537 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0355  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  41.87 
 
 		 1187 aa  893    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0573  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.38 
 
 		 1141 aa  819    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03800  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.8 
 
 		 1170 aa  806    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1492  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.55 
 
 		 1202 aa  778    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1598  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  100 
 
 		 1245 aa  2522    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0310456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6057  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  64.99 
 
 		 1141 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1782  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  42.77 
 
 		 1182 aa  894    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2707  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  84.15 
 
 		 1227 aa  2097    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.608751  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0391  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.2 
 
 		 1155 aa  705    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19910  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  56.76 
 
 		 1185 aa  751    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.168959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0565  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.86 
 
 		 1183 aa  1094    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4676  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.3 
 
 		 1489 aa  714    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.765247  hitchhiker  0.00735061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0636  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  55.62 
 
 		 1152 aa  690    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0216  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  69.22 
 
 		 1183 aa  862    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.846031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0244  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  77.82 
 
 		 1217 aa  1919    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2724  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  68.69 
 
 		 1250 aa  880    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.280863  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0969  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.44 
 
 		 1166 aa  825    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2162  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  63.91 
 
 		 1141 aa  784    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.906254  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17250  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.52 
 
 		 1168 aa  792    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0859  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  69.03 
 
 		 1238 aa  863    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111826  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2722  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.3 
 
 		 1234 aa  827    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.304828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2408  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.3 
 
 		 1234 aa  826    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0154863  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0917  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.13 
 
 		 1158 aa  781    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.456862 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2939  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.18 
 
 		 1102 aa  1083    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2697  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.64 
 
 		 1169 aa  1155    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.275742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5203  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.54 
 
 		 1177 aa  1169    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000890566  unclonable  1.148e-23 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20950  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.5 
 
 		 1161 aa  800    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.81555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0488  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  60.28 
 
 		 1099 aa  746    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2341  DNA-directed RNA polymerase  53.63 
 
 		 1107 aa  1195    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0804  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.24 
 
 		 1228 aa  886    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0442499  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18861  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.7 
 
 		 1095 aa  1064    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.816976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1016  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.01 
 
 		 1122 aa  736    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1981  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.64 
 
 		 1196 aa  788    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1375  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit/140 kD subunit  61.88 
 
 		 1197 aa  775    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0284  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.62 
 
 		 1212 aa  777    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000140323 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1825  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.76 
 
 		 1202 aa  781    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1845  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.47 
 
 		 1193 aa  881    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2984  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.49 
 
 		 1171 aa  1142    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.816436  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0462  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.75 
 
 		 1263 aa  768    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0680  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  62.44 
 
 		 1171 aa  803    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01090  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  69.57 
 
 		 1090 aa  857    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000929297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0414  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  69.43 
 
 		 1115 aa  875    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0178041  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0299  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.97 
 
 		 1169 aa  1161    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.289387 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0965  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.73 
 
 		 1187 aa  758    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3687  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  62.33 
 
 		 1278 aa  801    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0711  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.33 
 
 		 1166 aa  797    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0987  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.44 
 
 		 1172 aa  825    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.65546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0186  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  65.27 
 
 		 1174 aa  846    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.648806 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1257  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.94 
 
 		 1161 aa  825    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.568598 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0312  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  58.56 
 
 		 1246 aa  970    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5097  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  63.57 
 
 		 1174 aa  825    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0605321 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0207  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  71.52 
 
 		 1145 aa  868    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000841151  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0580  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.46 
 
 		 1170 aa  792    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0311917 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0974  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  64.84 
 
 		 1070 aa  777    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000799261  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16651  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.71 
 
 		 1097 aa  1082    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1778  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.69 
 
 		 1103 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1751  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  61.69 
 
 		 1103 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>