293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1544 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1544  magnesium chelatase ATPase subunit I  100 
 
 		 377 aa  751    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000269356 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1902  magnesium chelatase ATPase subunit I  94.69 
 
 		 379 aa  688    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3123  magnesium chelatase ATPase subunit I  70.43 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0785  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.56 
 
 		 384 aa  413  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.98065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2505  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.47 
 
 		 337 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.57993  normal  0.244137 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2728  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.47 
 
 		 337 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.111269 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1046  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.94 
 
 		 383 aa  409  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1796  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.72 
 
 		 391 aa  410  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2433  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.68 
 
 		 337 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1631  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  59.49 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.374894  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1621  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.68 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1438  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.76 
 
 		 383 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0127945  normal  0.972517 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1835  magnesium chelatase ATPase subunit I  60.11 
 
 		 336 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.053644 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1693  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.57 
 
 		 340 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.578375  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4017  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.43 
 
 		 340 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0371739  normal  0.311095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1250  magnesium chelatase ATPase subunit I  58.29 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136205 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3771  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.43 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0136041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0970  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.06 
 
 		 369 aa  388  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.726798  normal  0.50852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0485  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  57.82 
 
 		 394 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1493  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.86 
 
 		 386 aa  390  1e-107  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6449  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  58.62 
 
 		 348 aa  388  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2068  magnesium chelatase ATPase subunit I  59.26 
 
 		 341 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.876863 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3731  magnesium chelatase ATPase subunit I  61.13 
 
 		 368 aa  381  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.786606  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1519  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  55.71 
 
 		 374 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0208517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3622  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.25 
 
 		 405 aa  380  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1622  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.09 
 
 		 341 aa  379  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3280  magnesium chelatase ATPase subunit I  55.43 
 
 		 373 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0648  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.7 
 
 		 357 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3502  magnesium chelatase subunit I  56.98 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602006  normal  0.630421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0273  magnesium chelatase subunit I  58.91 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1916  magnesium chelatase subunit I  58.91 
 
 		 334 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.808705 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0454  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.39 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0467  magnesium chelatase ATPase subunit I  54.39 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.571149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1022  magnesium chelatase subunit I  58.62 
 
 		 334 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0936495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11611  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.72 
 
 		 362 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11601  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  52.72 
 
 		 362 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1952  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  56.05 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0857411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0713  magnesium chelatase ATPase subunit I  56.64 
 
 		 362 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0583  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.29 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00224642  normal  0.0296662 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11461  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  53.3 
 
 		 362 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.134782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11361  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.28 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.810628 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15321  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.57 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1066  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.05 
 
 		 362 aa  359  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0698  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  54.57 
 
 		 362 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1208  magnesium chelatase  53.85 
 
 		 372 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1776  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  51.63 
 
 		 688 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0556  Magnesium chelatase  52.79 
 
 		 346 aa  354  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0291  magnesium chelatase, ChlI subunit  50.6 
 
 		 680 aa  348  1e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0636  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  54.03 
 
 		 616 aa  348  1e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.122113  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0449  magnesium chelatase  51.88 
 
 		 669 aa  347  2e-94  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0156382  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08951  protoporphyrin IX magnesium chelatase subunit ChlI  56.34 
 
 		 363 aa  344  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.469371 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0497  magnesium chelatase  50.43 
 
 		 346 aa  338  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0414874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3856  Magnesium chelatase  53.25 
 
 		 365 aa  338  8e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1433  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.28 
 
 		 337 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1420  magnesium chelatase  51.6 
 
 		 364 aa  335  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.79128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2083  magnesium chelatase  51.14 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119495  Magnesium-protoporyphyrin IX chelatase subunit chlI  49.86 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0612628  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0108  magnesium chelatase  47.45 
 
 		 356 aa  332  5e-90  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.013372  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3097  magnesium chelatase  50.15 
 
 		 364 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.822319  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0145  magnesium chelatase subunit I  57.59 
 
 		 339 aa  330  2e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2299  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  49.16 
 
 		 788 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.291711  normal  0.0239656 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0375  magnesium chelatase  49.25 
 
 		 637 aa  325  1e-87  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.165558  normal  0.638672 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0229  magnesium chelatase  49.25 
 
 		 637 aa  323  3e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1192  Magnesium chelatase  50.73 
 
 		 696 aa  322  6e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000678359  hitchhiker  0.00162635 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1276  Magnesium chelatase  49.85 
 
 		 351 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1021  Magnesium chelatase  50.3 
 
 		 347 aa  320  3e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29195  predicted protein  46.88 
 
 		 443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.181731  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4158  magnesium chelatase  53.98 
 
 		 776 aa  319  6e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0127951  normal  0.72272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1910  Magnesium chelatase  51.67 
 
 		 660 aa  318  1e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1262  magnesium chelatase  47.41 
 
 		 345 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.885997  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3857  ATPase associated with various cellular activities AAA_5  48.81 
 
 		 665 aa  307  2.0000000000000002e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.149974  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03742  chelatase protein  51.34 
 
 		 637 aa  306  3e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.84057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1209  magnesium chelatase  54.41 
 
 		 670 aa  306  3e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1006  von Willebrand factor type A  48.43 
 
 		 749 aa  306  3e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1261  magnesium chelatase  50.91 
 
 		 689 aa  297  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17760  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  48.13 
 
 		 674 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0546  cobaltochelatase subunit  53.04 
 
 		 674 aa  293  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5368  Sigma 54 interacting domain protein  46.69 
 
 		 614 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5861  Magnesium chelatase  51.34 
 
 		 680 aa  292  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2527  magnesium chelatase  52.17 
 
 		 738 aa  286  4e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.102647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5885  chelatase protein  52.33 
 
 		 713 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0403011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0313  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  52.79 
 
 		 673 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2709  magnesium chelatase  53.04 
 
 		 730 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000369585 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0125  magnesium chelatase  42.51 
 
 		 356 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00707202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0159  Magnesium chelatase  51.18 
 
 		 705 aa  281  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6039  Magnesium chelatase  51.28 
 
 		 719 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0751  magnesium chelatase subunit D/I family protein  42.9 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.426772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1309  cobaltochelatase subunit  52.59 
 
 		 657 aa  278  2e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.441078  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1860  Magnesium chelatase  50.3 
 
 		 719 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.217661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2489  von Willebrand factor type A  52.84 
 
 		 690 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.325588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1621  von Willebrand factor type A  49.13 
 
 		 699 aa  265  8e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921819  normal  0.480885 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4585  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  47.87 
 
 		 335 aa  264  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4050  magnesium chelatase  44.06 
 
 		 626 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1700  Sigma 54 interacting domain protein  47.38 
 
 		 618 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25990  putative magnesium chelatase  48.17 
 
 		 337 aa  260  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0838506  normal  0.479332 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3462  magnesium chelatase ChlI subunit  47.16 
 
 		 754 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2054  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.27 
 
 		 622 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.457872  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3148  magnesium chelatase, subunit ChII, putative  46.31 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13860  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  43.6 
 
 		 351 aa  258  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2117  protoporphyrin IX magnesium-chelatase  45.27 
 
 		 622 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0165109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>