117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1520 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  527  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  82.63 
 
 
235 aa  333  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  82.11 
 
 
249 aa  332  5e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  45.25 
 
 
274 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  46.74 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  37.07 
 
 
238 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  36.75 
 
 
245 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  40.1 
 
 
225 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  41.1 
 
 
231 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  36.69 
 
 
251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  36.76 
 
 
222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  35.78 
 
 
237 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  34.84 
 
 
259 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  35.19 
 
 
232 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  34.82 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  34.82 
 
 
241 aa  98.6  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1545  hypothetical protein  34.65 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  34.63 
 
 
284 aa  96.7  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  35.35 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  32.79 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  35.03 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  34.22 
 
 
252 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  36.32 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  33.78 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  32.07 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  33.05 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  33.05 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  34.13 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3638  protein of unknown function DUF820  30.15 
 
 
252 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  34.06 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  34.06 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2476  protein of unknown function DUF820  36 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  29.46 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  36.29 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  36.29 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  28.87 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  32.73 
 
 
229 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  35.64 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  35.23 
 
 
210 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  35.29 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2223  hypothetical protein  38.84 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3182  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0784851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  37.86 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3372  protein of unknown function DUF820  35.56 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  27.05 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  27.05 
 
 
250 aa  77  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3222  protein of unknown function DUF820  34.08 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  31.32 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  30.74 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  31.72 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  32.48 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  31.2 
 
 
272 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5551  protein of unknown function DUF820  29.8 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.540442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3372  hypothetical protein  36.72 
 
 
259 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1069  hypothetical protein  31.55 
 
 
259 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  31.36 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3375  hypothetical protein  36.22 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  34.29 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3373  hypothetical protein  36.22 
 
 
245 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3374  hypothetical protein  36.22 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  33.59 
 
 
227 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2196  hypothetical protein  31.31 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.203232  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  32.6 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  30.23 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0590  protein of unknown function DUF820  31.17 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2812  hypothetical protein  31.98 
 
 
252 aa  67  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00715038  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1065  hypothetical protein  33.57 
 
 
192 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  31.97 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  31.97 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1187  protein of unknown function DUF820  29.05 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000133784  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  33.62 
 
 
236 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  35.2 
 
 
319 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  42.22 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  27.04 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  30.77 
 
 
200 aa  53.5  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1743  hypothetical protein  27.75 
 
 
245 aa  53.5  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.311817  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  33.65 
 
 
248 aa  53.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0795  hypothetical protein  30.19 
 
 
287 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  46.27 
 
 
402 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1443  hypothetical protein  28.08 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0721  protein of unknown function DUF820  31.01 
 
 
254 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00402744  normal  0.197954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  46.38 
 
 
350 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  27.21 
 
 
295 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  44.78 
 
 
376 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  46.38 
 
 
340 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  38.36 
 
 
188 aa  49.3  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4444  hypothetical protein  31.91 
 
 
334 aa  48.9  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0323466  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0693  protein of unknown function DUF820  31.9 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  39.77 
 
 
290 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4441  hypothetical protein  31.91 
 
 
285 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000651212  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  35.48 
 
 
185 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4440  hypothetical protein  31.21 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0116829  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  46.88 
 
 
339 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  45.31 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4442  hypothetical protein  31.21 
 
 
243 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000374354  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4443  hypothetical protein  29.03 
 
 
264 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000339677  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  30.97 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  29.83 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>