More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1480 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  449  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  92.27 
 
 		 220 aa  424  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  61.19 
 
 		 219 aa  278  5e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  63.26 
 
 		 218 aa  276  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2766  two component transcriptional regulator  52.78 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.327413  hitchhiker  0.000587872 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.94 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  43.3 
 
 		 1004 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  43.96 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  44.58 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  50.7 
 
 		 236 aa  74.7  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.31 
 
 		 246 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2520  FHA domain-containing protein  38.66 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837132 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.39 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2382  forkhead-associated protein  38.66 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.09 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.62 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31880  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.06 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.86 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1569  winged helix family two component response transcriptional regulator  47.95 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000954897  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.24 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  44.09 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.01 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3742  FHA domain-containing protein  42.86 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.160479 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2095  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  41.46 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  42.39 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  40.2 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.61 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  45.16 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.24 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.16 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  44.57 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.09 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  41.24 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  44.09 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.35 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.09 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3869  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0082  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 239 aa  70.5  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.66 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691187  normal  0.348936 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  46.84 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  41.98 
 
 		 851 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3379  two component heavy metal response transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.66 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.22 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  45.68 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  43.01 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1193  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.07 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  40.24 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3258  two component heavy metal response transcriptional regulator  48.68 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00206307  normal  0.0675777 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0793  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  43.75 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  40.24 
 
 		 237 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0559  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.17 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276329  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  39.02 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  38.61 
 
 		 238 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0771  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.204872  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3128  FHA domain containing protein  40.22 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2351  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.274912  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.13 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  45.24 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1040  DNA-binding response regulator  31.01 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  41.33 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2815  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.21 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.180318  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1119  DNA-binding response regulator  31.01 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2120  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.94 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>