17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1460 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1460  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  283  7e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.355787  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4136  hypothetical protein  89.05 
 
 
148 aa  234  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0508  hypothetical protein  33.81 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.944146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3243  hypothetical protein  33.79 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00128168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2670  hypothetical protein  28.57 
 
 
152 aa  63.2  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1545  hypothetical protein  38.58 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0030  hypothetical protein  29.5 
 
 
153 aa  60.5  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0009915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0587  hypothetical protein  30.37 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3406  hypothetical protein  26.32 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.088812  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3347  hypothetical protein  29.32 
 
 
155 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.184685  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0286  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0286  hypothetical protein  27.27 
 
 
148 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.81964  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6457  hypothetical protein  29.53 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4859  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0144  hypothetical protein  32.09 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_8856  predicted protein  25.9 
 
 
146 aa  42.7  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.198885 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33921  predicted protein  24.26 
 
 
251 aa  42.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>