55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1459 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1459  cytochrome oxidase assembly  100 
 
 		 337 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.494782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4134  cytochrome oxidase assembly  91.75 
 
 		 318 aa  549  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2414  cytochrome oxidase assembly  50.17 
 
 		 321 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0989704  normal  0.228946 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  47.06 
 
 		 624 aa  250  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0213  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0224  cytochrome oxidase assembly  50 
 
 		 318 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15999  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0707  cytochrome oxidase assembly  45.4 
 
 		 317 aa  235  7e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0200  cytochrome oxidase assembly protein  49.65 
 
 		 316 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.571706  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0545  cytochrome oxidase assembly  49.02 
 
 		 335 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0409  cytochrome oxidase assembly  45.05 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0340  cytochrome oxidase assembly  42.62 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.889697 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3961  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4049  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4064  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.839964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3993  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4156  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3706  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.006652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3689  cytochrome-c oxidase (cytochrome aa3 controlling protein)  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3858  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1191  cytochrome aa3 controlling protein  45.83 
 
 		 311 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3772  cytochrome oxidase assembly  45.24 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161471  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2648  cytochrome oxidase assembly  38.6 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1853  cytochrome oxidase assembly  42.71 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0981  cytochrome oxidase assembly  43.88 
 
 		 319 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1197  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1175  cytochrome oxidase assembly  27.01 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0705  cytochrome oxidase assembly protein  26.54 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.17 
 
 		 622 aa  63.2  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5475  cytochrome oxidase assembly  28.74 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22000  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  33.16 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.891794  normal  0.935402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1353  cytochrome oxidase assembly  34.44 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14570  uncharacterized protein required for cytochrome oxidase assembly  37.5 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.852831  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1977  cytochrome oxidase assembly  38.32 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.628163 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1803  cytochrome oxidase assembly  27.98 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1133  cytochrome oxidase assembly  29.37 
 
 		 370 aa  53.1  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2268  cytochrome oxidase assembly  35.11 
 
 		 337 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00686495  normal  0.0860504 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0662  cytochrome oxidase assembly  30.99 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0527  cytochrome oxidase assembly  25.91 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0186  hypothetical protein  27.54 
 
 		 137 aa  48.5  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.480963 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2217  cytochrome oxidase assembly  27.18 
 
 		 351 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000899528  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3827  cytochrome oxidase assembly  33.61 
 
 		 411 aa  46.6  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.502475 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2249  cytochrome oxidase assembly  26.78 
 
 		 386 aa  46.2  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0256  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 313 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0254  cytochrome oxidase assembly  28.28 
 
 		 313 aa  46.2  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3001  cytochrome oxidase assembly  31.61 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3689  cytochrome oxidase assembly  26.53 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2205  cytochrome oxidase assembly protein  32.06 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000750752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1135  cytochrome oxidase assembly  35.19 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3013  cytochrome oxidase assembly  30 
 
 		 267 aa  45.1  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.217193  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2347  cytochrome oxidase assembly  31.01 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0173507  normal  0.0130822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5672  cytochrome oxidase assembly  26.39 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.919236 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2076  cytochrome oxidase assembly  32 
 
 		 326 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.255138  normal  0.809724 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3572  cytochrome oxidase assembly  23.19 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2078  cytochrome oxidase assembly  26.69 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.7047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3264  cytochrome oxidase assembly  36.84 
 
 		 298 aa  43.5  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.133931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>