More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1457 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1457  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4002  ABC transporter related  95.65 
 
 
253 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410109  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  73.31 
 
 
249 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  72.92 
 
 
246 aa  370  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  71.37 
 
 
246 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1750  ABC glutamate/glutamine/aspartate/asparagine transporter, ATPase subunit bztD  70.34 
 
 
262 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135417  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  69.39 
 
 
269 aa  363  2e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  70.34 
 
 
262 aa  363  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0796  ABC transporter related  70.46 
 
 
257 aa  361  5.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241057  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2500  ABC transporter related  70.34 
 
 
262 aa  361  6e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0972134  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1001  ABC transporter component  70.9 
 
 
267 aa  361  7.0000000000000005e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.217472  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0519  ABC transporter related  69.44 
 
 
247 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0536  ABC transporter related  69.44 
 
 
247 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.21 
 
 
269 aa  359  2e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  67.84 
 
 
258 aa  358  4e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3557  ABC transporter related  67.34 
 
 
253 aa  357  8e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.233351 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  70.21 
 
 
249 aa  357  9.999999999999999e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  69.79 
 
 
257 aa  357  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  65.62 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  65.62 
 
 
258 aa  356  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  69.79 
 
 
257 aa  356  1.9999999999999998e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0985  ABC transporter related  67.9 
 
 
247 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.178128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5873  ABC transporter related  67.19 
 
 
273 aa  353  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0996004  normal  0.734051 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4395  ABC transporter related  69.14 
 
 
243 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0223537  normal  0.50723 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1116  ABC transporter related  70.51 
 
 
267 aa  353  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.888431  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7857  ABC transporter related  68.27 
 
 
261 aa  353  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  70.51 
 
 
256 aa  353  1e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  67.2 
 
 
268 aa  352  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6378  ABC transporter related  67.19 
 
 
273 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  68.35 
 
 
263 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  63.75 
 
 
259 aa  350  8.999999999999999e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  66.4 
 
 
254 aa  350  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  68.75 
 
 
254 aa  349  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  66.01 
 
 
254 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  66.01 
 
 
254 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  66.01 
 
 
254 aa  349  3e-95  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  66.13 
 
 
254 aa  348  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.16 
 
 
251 aa  347  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0321  glutamate/glutamine/aspartate/asparagine ABC transport ATP-binding  68.64 
 
 
258 aa  348  7e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276358  normal  0.457002 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3584  ABC transporter related  65.87 
 
 
255 aa  347  8e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.34638  normal  0.0302261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1258  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 
254 aa  347  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.13929  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  67.37 
 
 
263 aa  347  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3655  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  65.34 
 
 
252 aa  346  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2327  ABC transporter related  66.67 
 
 
252 aa  346  2e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.653691  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  64.34 
 
 
249 aa  345  3e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3704  ABC transporter related  65.85 
 
 
253 aa  345  5e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.310389  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  66.24 
 
 
266 aa  344  8e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.54 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  63.93 
 
 
249 aa  344  8.999999999999999e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0226  ABC transporter related  65.6 
 
 
253 aa  344  8.999999999999999e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.942715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  66.53 
 
 
251 aa  343  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.54 
 
 
252 aa  344  1e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.54 
 
 
252 aa  344  1e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3710  ABC transporter related  64.54 
 
 
252 aa  343  1e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.110417 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  69.01 
 
 
244 aa  343  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  62.9 
 
 
249 aa  343  2e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  64.14 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  64.14 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  64.14 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3860  ABC transporter related  65.04 
 
 
253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.192175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.14 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  64.14 
 
 
252 aa  342  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0230  ABC transporter related protein  64.8 
 
 
253 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.653614  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4549  ABC transporter related  62.11 
 
 
258 aa  342  4e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2561  ABC transporter related  65.56 
 
 
246 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  65.43 
 
 
259 aa  341  8e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2909  ABC transporter related  65.15 
 
 
246 aa  339  2e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.530548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3926  putative amino acid transport protein, ATP-binding protein  63.01 
 
 
247 aa  340  2e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.296191  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1526  ABC transporter, ATPase subunit  66.67 
 
 
247 aa  339  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.529546  normal  0.291896 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2552  ABC transporter related  64.2 
 
 
245 aa  338  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221216  normal  0.68713 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0123  ABC transporter related  63.45 
 
 
255 aa  337  9e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2835  ABC transporter related  65.15 
 
 
246 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.950118  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  66.8 
 
 
252 aa  335  3.9999999999999995e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4427  ABC transporter related  66.24 
 
 
254 aa  333  2e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2846  ABC transporter related  64.75 
 
 
251 aa  332  4e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.92934  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_002936  DET0417  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.14 
 
 
253 aa  331  6e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00684125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_360  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  64.54 
 
 
284 aa  330  1e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000584312  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3674  ABC transporter related  65.83 
 
 
265 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2068  ABC transporter related  64.9 
 
 
247 aa  328  4e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1959  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  62.15 
 
 
251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0443525  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3950  AABC amino acid transporter, ATPase subunit  65.81 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2987  ABC transporter related  63.64 
 
 
257 aa  325  3e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.715624  normal  0.638101 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0396  ABC transporter related  62.95 
 
 
253 aa  324  8.000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000127447  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1488  ABC transporter related  61.94 
 
 
265 aa  323  1e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.32333  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1885  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.75 
 
 
251 aa  323  2e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00643068  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1075  ABC transporter related  60.48 
 
 
250 aa  323  2e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0249  ATPase  63.97 
 
 
261 aa  322  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  62.1 
 
 
252 aa  322  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5511  ABC transporter related  60.16 
 
 
247 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233836  decreased coverage  0.000387504 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1048  ABC transporter-like protein  63.27 
 
 
245 aa  321  7e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1741  ABC transporter related  64.58 
 
 
267 aa  321  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3296  ABC transporter related  61.72 
 
 
256 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.835077  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4870  ABC transporter related  60.78 
 
 
256 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.933928  normal  0.605559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3961  ABC transporter related  61.57 
 
 
248 aa  318  3e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.533772 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2825  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.7 
 
 
248 aa  319  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2821  ABC transporter for amino acids ATP-binding protein  58.7 
 
 
248 aa  317  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.668457  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0713  ABC transporter related protein  64.46 
 
 
245 aa  316  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0161092  normal  0.0156766 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3991  ABC transporter related  60.73 
 
 
261 aa  316  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  61.86 
 
 
242 aa  316  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2581  ABC transporter related  60.82 
 
 
255 aa  315  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.507078  normal  0.289132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>