153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1385 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4113  glycoside hydrolase family protein  86.56 
 
 
424 aa  749    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1385  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
424 aa  862    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.382298  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002438  6-phospho-beta-glucosidase  46.19 
 
 
440 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03622  6-phospho-beta-glucosidase  45.96 
 
 
440 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0266  glycoside hydrolase family protein  45.01 
 
 
436 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0903  6-phospho-beta-glucosidase  44.57 
 
 
440 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.851589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3871  glycoside hydrolase family 4  42.07 
 
 
436 aa  340  2e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3310  glycoside hydrolase family 4  43.09 
 
 
447 aa  339  7e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3951  6-phospho-beta-glucosidase  43.29 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0241  glycoside hydrolase family protein  43.29 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5631  6-phospho-beta-glucosidase  42.36 
 
 
441 aa  335  7e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000180851 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1857  glycoside hydrolase family protein  44.44 
 
 
433 aa  334  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5373  6-phospho-beta-glucosidase  42.36 
 
 
441 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4591  glycoside hydrolase family protein  43.98 
 
 
435 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5328  6-phospho-beta-glucosidase  42.13 
 
 
441 aa  333  4e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5056  6-phospho-beta-glucosidase  42.13 
 
 
441 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5441  6-phospho-beta-glucosidase  42.13 
 
 
441 aa  333  5e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3751  glycoside hydrolase family protein  42.13 
 
 
441 aa  332  6e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1024  putative 6-phospho-beta-glucosidase  40.37 
 
 
440 aa  332  7.000000000000001e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4886  6-phospho-beta-glucosidase  41.9 
 
 
441 aa  332  9e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5318  6-phospho-beta-glucosidase  42.13 
 
 
441 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5297  6-phospho-beta-glucosidase  41.67 
 
 
441 aa  331  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000744026 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4901  6-phospho-beta-glucosidase  41.67 
 
 
441 aa  330  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5001  6-phospho-beta-glucosidase  41.9 
 
 
441 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1677  glycoside hydrolase family 4  40.7 
 
 
416 aa  321  1.9999999999999998e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5823  hypothetical protein  44.52 
 
 
419 aa  319  5e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7349  glycoside hydrolase family 4  44.71 
 
 
422 aa  318  9e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197133 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3345  glycoside hydrolase family 4  40.74 
 
 
441 aa  315  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0472  glycoside hydrolase family 4  38.68 
 
 
468 aa  312  5.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.507113  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1538  glycoside hydrolase family protein  41.53 
 
 
415 aa  299  7e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1490  glycoside hydrolase family protein  41.39 
 
 
415 aa  297  2e-79  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0495802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1710  6-phospho-beta-glucosidase  39.37 
 
 
451 aa  283  4.0000000000000003e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1955  6-phospho-beta-glucosidase  38.24 
 
 
450 aa  280  3e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1457  6-phospho-beta-glucosidase  38.24 
 
 
450 aa  280  3e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.307049 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1908  glycoside hydrolase family 4  38.24 
 
 
450 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.12949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01703  cryptic phospho-beta-glucosidase, NAD(P)-binding  38.01 
 
 
450 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1816  6-phospho-beta-glucosidase  37.95 
 
 
450 aa  277  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.703713  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2452  6-phospho-beta-glucosidase  38.01 
 
 
450 aa  277  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01691  hypothetical protein  38.01 
 
 
450 aa  278  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.797624  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1898  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 
450 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.696753  normal  0.423209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1430  6-phospho-beta-glucosidase  37.5 
 
 
451 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1445  6-phospho-beta-glucosidase  37.5 
 
 
451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.597684  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1413  6-phospho-beta-glucosidase  37.27 
 
 
451 aa  272  7e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.790472  normal  0.0216334 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1855  6-phospho-beta-glucosidase  37.27 
 
 
451 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.545492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2028  6-phospho-beta-glucosidase  37.27 
 
 
451 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3858  glycoside hydrolase family 4  33.88 
 
 
427 aa  229  8e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2132  glycoside hydrolase family 4  33.41 
 
 
432 aa  225  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1614  glycoside hydrolase family 4  29.43 
 
 
459 aa  208  2e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4107  glycoside hydrolase family 4  30.59 
 
 
460 aa  207  4e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2007  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 
461 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0536804 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4393  glycoside hydrolase family protein  31.83 
 
 
461 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0310386  normal  0.707093 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0265  glycoside hydrolase family 4  32.03 
 
 
453 aa  190  5e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5443  glycoside hydrolase family 4  30.23 
 
 
447 aa  189  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3020  6-phospho-beta-glucosidase  31.98 
 
 
453 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3066  Maltose-6'-phosphate glucosidase  29.91 
 
 
442 aa  187  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.495439  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1458  glycoside hydrolase family 4  32.59 
 
 
410 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.453391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3016  glycoside hydrolase family protein  30.47 
 
 
455 aa  179  9e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.547717  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2617  glycoside hydrolase family 4  31.42 
 
 
447 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0255431  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2768  6-phospho-beta-glucosidase  31.57 
 
 
460 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00830  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  30.65 
 
 
485 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4649  glycoside hydrolase family 4  29.32 
 
 
435 aa  168  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2898  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 
466 aa  163  6e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0454  glycoside hydrolase family 4  27.21 
 
 
442 aa  162  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000262925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2608  glycoside hydrolase family 4  31.88 
 
 
465 aa  155  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000222625 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4484  glycoside hydrolase family 4  29.98 
 
 
439 aa  152  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0542529  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5112  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.35 
 
 
440 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.694911 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03565  predicted 6-phospho-beta-glucosidase  27.35 
 
 
440 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03508  hypothetical protein  27.35 
 
 
440 aa  150  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3893  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.33 
 
 
440 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4045  maltose-6'-phosphate glucosidase  27.35 
 
 
440 aa  149  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3322  Maltose-6'-phosphate glucosidase  27.01 
 
 
442 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0018  glycoside hydrolase family protein  26.52 
 
 
440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4144  glycoside hydrolase family protein  27.05 
 
 
457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.663959 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0021  glycoside hydrolase family protein  27.54 
 
 
440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1104  glycoside hydrolase family 4  27.9 
 
 
438 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3661  glycoside hydrolase family 4  27.8 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000411  maltose-6'-phosphate glucosidase  26.53 
 
 
442 aa  145  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23300  glycoside hydrolase family 4  27.27 
 
 
432 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0384  glycoside hydrolase family 4  26.93 
 
 
441 aa  145  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2588  glycoside hydrolase family 4  30.54 
 
 
457 aa  143  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0445  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 
426 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482345  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0797  glycoside hydrolase family 4  27.85 
 
 
432 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.482234  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3103  glycoside hydrolase family protein  29.26 
 
 
435 aa  139  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.199701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2891  glycoside hydrolase family protein  27.62 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01850  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.92 
 
 
435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5903  glycoside hydrolase family 4  26.06 
 
 
456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4885  glycoside hydrolase family 4  30.35 
 
 
430 aa  133  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0382  glycoside hydrolase family 4  27.8 
 
 
426 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.126645  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6873  glycoside hydrolase family 4  25.84 
 
 
456 aa  133  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1884  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1002  glycoside hydrolase family 4  26.56 
 
 
489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0216  glycoside hydrolase family 4  25.34 
 
 
441 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5115  alpha-galactosidase  25.39 
 
 
453 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05010  family 4 glycosyl hydrolase, alpha-galactosidase/6-phospho-beta-glucosidase  28.21 
 
 
462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0137  glycoside hydrolase family 4  26.4 
 
 
439 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5795  glycoside hydrolase family 4  30.13 
 
 
430 aa  128  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1245  glycoside hydrolase family 4  29.12 
 
 
446 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51420  alpha-galactosidase  27.63 
 
 
441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4553  alpha-galactosidase  26.5 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226909  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4562  alpha-galactosidase  26.5 
 
 
451 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>