More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1383 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  100 
 
 		 289 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  73.24 
 
 		 285 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  60.22 
 
 		 293 aa  295  4e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0267  HemK family modification methylase  51.79 
 
 		 283 aa  286  4e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1021  HemK family modification methylase  47.49 
 
 		 277 aa  232  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1211  HemK family modification methylase  48.65 
 
 		 277 aa  222  7e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_994  modification methylase, HemK family  47.49 
 
 		 277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  42.01 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0065  modification methylase, HemK family  44.03 
 
 		 289 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787039  hitchhiker  0.00284292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2396  HemK family modification methylase  48.75 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.299117 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3974  modification methylase, HemK family  43.75 
 
 		 307 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  44.53 
 
 		 283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  38.01 
 
 		 279 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  44.4 
 
 		 288 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2082  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.4 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000794612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0064  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.32 
 
 		 287 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292458  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  45.38 
 
 		 284 aa  187  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  45.42 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.39 
 
 		 283 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.4 
 
 		 283 aa  186  6e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3169  HemK family modification methylase  40.56 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0174624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  39.39 
 
 		 283 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  39.39 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0381  modification methylase HemK  44.02 
 
 		 284 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  39.39 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.39 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  38.02 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  38.78 
 
 		 283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.77 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.39 
 
 		 283 aa  183  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  44.78 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  39.02 
 
 		 283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0395  modification methylase, HemK family  46.3 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  37.64 
 
 		 283 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0393  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  46.13 
 
 		 286 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  36.04 
 
 		 285 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.96 
 
 		 293 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  47.1 
 
 		 280 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2985  HemK family modification methylase  41.52 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.45 
 
 		 297 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  46.5 
 
 		 311 aa  175  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4214  HemK family modification methylase  46.84 
 
 		 285 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  41.54 
 
 		 285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3505  HemK family modification methylase  41.48 
 
 		 289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.216122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0473  HemK family modification methylase  40.91 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000302756  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1425  modification methylase HemK  41.79 
 
 		 297 aa  172  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  40.38 
 
 		 284 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0851  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.64 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0252199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1714  HemK family modification methylase  42.54 
 
 		 288 aa  171  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69784  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1555  HemK family modification methylase  45.32 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502304 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1490  modification methylase HemK  41.44 
 
 		 296 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0987  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.64 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.17 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  43.24 
 
 		 288 aa  169  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2428  HemK family modification methylase  35.81 
 
 		 302 aa  168  8e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.185206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0521  HemK protein, putative protoporphyrinogen oxidase  45.08 
 
 		 274 aa  168  9e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  45.07 
 
 		 287 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  47.04 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  41.83 
 
 		 280 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  38.71 
 
 		 277 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2497  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.42 
 
 		 288 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.327963  normal  0.48077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7605  putative methyltransferase hemK modifies release factors RF-1 and RF-2  41.83 
 
 		 295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.477102  normal  0.154369 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1309  modification methylase, HemK family  38.72 
 
 		 297 aa  166  4e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.114861 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  44.52 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4749  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.45 
 
 		 295 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0365  HemK family modification methylase  43.91 
 
 		 286 aa  165  8e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  45.05 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  39.04 
 
 		 271 aa  165  8e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.62 
 
 		 279 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  43.4 
 
 		 287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2779  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.64 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.159929  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1085  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.47 
 
 		 299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00355762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  39.69 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1807  HemK family modification methylase  41.25 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.371396  normal  0.196603 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  44.49 
 
 		 278 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1050  protein methyltransferase HemK  43.53 
 
 		 284 aa  162  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  37.23 
 
 		 280 aa  162  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04588  protein methyltransferase HemK (Protein-glutamine N-methyltransferase hemK) (Protein-(glutamine-N5) MTase hemK)  43.07 
 
 		 281 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0469  HemK family modification methylase  41.92 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.667677  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0917  modification methylase, HemK family  45.49 
 
 		 296 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.784993 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  33.45 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2906  putative methylase  48.05 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0954  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.11 
 
 		 296 aa  159  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00257436  normal  0.0446983 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.15 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2713  HemK family modification methylase  40.71 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  46.3 
 
 		 275 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  43.01 
 
 		 270 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2622  HemK family modification methylase  42.15 
 
 		 286 aa  159  7e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.628376 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  39.15 
 
 		 281 aa  158  9e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  35.2 
 
 		 276 aa  158  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0481  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  42.96 
 
 		 280 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.589534 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2722  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.51 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0121  protein methyltransferase HemK  38.63 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000176405  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  38.69 
 
 		 279 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0999  HemK family modification methylase  42.4 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0287  HemK family modification methylase  43.77 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4147  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.01 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0376  modification methylase HemK  41.92 
 
 		 298 aa  157  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.146746  normal  0.807288 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2596  HemK family modification methylase  42.6 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.944902  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0509  HemK family modification methylase  42.6 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>