More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1349 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1349  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  786    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4266  glycosyl transferase, group 1  80.46 
 
 
395 aa  608  1e-173  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1350  glycosyl transferase group 1  51.53 
 
 
406 aa  349  5e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4267  glycosyl transferase, group 1  49.37 
 
 
406 aa  317  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 
377 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
385 aa  147  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4006  glycosyl transferase, group 1  32.04 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.927279  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
381 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  32.91 
 
 
426 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  37.91 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2752  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
401 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.08 
 
 
366 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  32.67 
 
 
378 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
384 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31 
 
 
393 aa  107  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.63 
 
 
398 aa  107  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  31.12 
 
 
379 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2463  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
385 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  31.46 
 
 
387 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4004  glycosyl transferase group 1  30.75 
 
 
398 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3034  glycosyl transferase, group 1  28.04 
 
 
360 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  28.5 
 
 
361 aa  103  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0580  glycosyl transferase group 1  31.57 
 
 
399 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.55279  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
403 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.44 
 
 
394 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3803  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
390 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.395317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3514  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
376 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
392 aa  100  5e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3106  glycosyl transferase group 1  37.72 
 
 
382 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  30.52 
 
 
364 aa  99.8  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  35 
 
 
366 aa  97.8  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0860  glycosyl transferase group 1  30.32 
 
 
378 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0411  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0890  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
378 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.172669  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3987  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 
378 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.107923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1923  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 
368 aa  96.3  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.80295  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3282  glycosyl transferase, group 1  36.84 
 
 
377 aa  95.9  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0112  glycosyl transferase, group 1  26.85 
 
 
367 aa  95.1  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.08 
 
 
365 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
381 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.71 
 
 
381 aa  94  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.71 
 
 
381 aa  94  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.71 
 
 
381 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
381 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
381 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2637  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
345 aa  93.6  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30000  Glycosyl transferase, group 1 family protein  31.41 
 
 
370 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.71 
 
 
381 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2364  Glycosyltransferase-like protein  27.55 
 
 
395 aa  92.8  8e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2461  glycosyl transferase group 1  33.04 
 
 
374 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 
384 aa  92  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  32.93 
 
 
391 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 
395 aa  92  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0780  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
378 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 
378 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1426  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
387 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  39.46 
 
 
398 aa  92  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2500  glycosyl transferase group 1  29.88 
 
 
378 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.497379  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 
360 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
381 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0769  glycosyl transferase, group 1  38.86 
 
 
378 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.551648  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 
403 aa  90.5  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  29.09 
 
 
380 aa  90.5  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2253  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.38 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.531555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2105  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 
371 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.352856  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2460  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
381 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  38.16 
 
 
381 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2883  polysaccharide pyruvyl transferase  26.91 
 
 
745 aa  89.4  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3055  glycosyl transferase, group 1  32.12 
 
 
439 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  30.56 
 
 
399 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  27.03 
 
 
362 aa  88.2  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2631  glycosyl transferase group 1  32.45 
 
 
408 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112011  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2820  glycosyl transferase group 1  31.17 
 
 
380 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  36.77 
 
 
401 aa  87  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1819  glycosyl transferase group 1  37.13 
 
 
373 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103327  normal  0.199615 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  25.3 
 
 
745 aa  87  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 
381 aa  86.7  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4263  glycosyl transferase, group 1  29.66 
 
 
396 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.06 
 
 
365 aa  86.3  9e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0754  glycosyl transferase group 1  34.11 
 
 
505 aa  86.3  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1477  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
406 aa  86.3  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1259  glycosyl transferase group 1  24.29 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.509892  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3357  glycosyl transferase group 1  32.94 
 
 
388 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.656502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1304  group 1 glycosyl transferase  35.89 
 
 
388 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0596732  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  39.57 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0917  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
382 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1149  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 
389 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00373212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2681  glycosyl transferase group 1  32.88 
 
 
376 aa  85.1  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3059  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000425383  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1545  glycosyl transferase group 1  36.78 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0675675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6075  glycosyl transferase group 1  29.06 
 
 
390 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.353621  normal  0.425913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2725  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 
380 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.409624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3529  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
386 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000647239  normal  0.0162837 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1486  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.153331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  30.74 
 
 
423 aa  84  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  33.5 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>