More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1344 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  100 
 
 
226 aa  439  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  79.3 
 
 
227 aa  337  9.999999999999999e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  55.56 
 
 
229 aa  224  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  40.28 
 
 
209 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  41.63 
 
 
212 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  40.76 
 
 
220 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  38.32 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  36.15 
 
 
223 aa  125  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  37.86 
 
 
202 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  38.86 
 
 
204 aa  123  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  38.76 
 
 
211 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  36.45 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  43.81 
 
 
214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  41.9 
 
 
196 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  36.59 
 
 
196 aa  112  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  38.43 
 
 
211 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  38.76 
 
 
212 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  37.98 
 
 
210 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  31.88 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  38.79 
 
 
209 aa  108  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  31.88 
 
 
210 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  36.36 
 
 
210 aa  108  8.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  33.66 
 
 
203 aa  107  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  31.43 
 
 
210 aa  106  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  33.01 
 
 
211 aa  105  5e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  35.68 
 
 
213 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  35.85 
 
 
214 aa  104  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  33.65 
 
 
218 aa  103  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  33.65 
 
 
227 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  36.1 
 
 
195 aa  103  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  38.42 
 
 
212 aa  103  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
205 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  35.19 
 
 
206 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  30.29 
 
 
203 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  34.95 
 
 
194 aa  101  1e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  33.97 
 
 
371 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  34.29 
 
 
212 aa  98.6  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  29.81 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  32.86 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  29.95 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  38.21 
 
 
206 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  29.47 
 
 
203 aa  95.5  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  34.13 
 
 
221 aa  95.5  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000513916  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  34.13 
 
 
217 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  35.05 
 
 
209 aa  95.1  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  37.74 
 
 
296 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  40 
 
 
269 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0218  hexapaptide repeat-containing transferase  36.15 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3899  putative acetyltransferase protein  32.06 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  30.43 
 
 
213 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  32.57 
 
 
213 aa  92  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0572  putative acetyltransferase  33.87 
 
 
197 aa  92  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0399272  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  29.81 
 
 
204 aa  92  7e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2607  putative acetyltransferase  34.29 
 
 
190 aa  92  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000773835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3233  polysialic acid capsule biosynthesis protein NeuD  30.43 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.728164  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1515  hexapaptide repeat-containing transferase  32.02 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  30.33 
 
 
227 aa  91.3  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  31.25 
 
 
212 aa  90.1  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  32.86 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0101  hexapeptide transferase family protein  33.17 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3879  hexapeptide repeat-containing transferase  33.17 
 
 
210 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  30.92 
 
 
192 aa  90.1  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  33.49 
 
 
214 aa  89.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  32.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  32.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  32.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  32.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  32.68 
 
 
210 aa  89  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.06 
 
 
365 aa  88.6  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  28.3 
 
 
209 aa  88.2  9e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.44 
 
 
181 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4433  pilin glycosylation protein  40.38 
 
 
194 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  32.88 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  32.88 
 
 
214 aa  86.3  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1466  hypothetical protein  33.16 
 
 
236 aa  85.1  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0046355  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1736  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.5 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  31 
 
 
209 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01411  carbonic anhydrase  25.35 
 
 
226 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  30.48 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  33.12 
 
 
174 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  36.88 
 
 
207 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1575  acetyltransferase (the isoleucine patch superfamily)  28.37 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  9.09781e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.57 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  27.32 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3060  hexapaptide repeat-containing transferase  33.64 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.820425  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1876  hypothetical protein  32.57 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.851217 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3010  putative capsular polysaccharide biosynthesis protein NeuD  27.18 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118792  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2245  pilin glycosylation protein  33.15 
 
 
192 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0796956  normal  0.0504546 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  31.11 
 
 
181 aa  79  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0611  acetyltransferase  30.95 
 
 
216 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  31.55 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8498  acetyltransferase  36.92 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.898885  normal  0.46158 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2767  putative serine O-acetyltransferase  30.41 
 
 
215 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  28.5 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3981  hypothetical protein  30.66 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  32.86 
 
 
213 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  28.02 
 
 
216 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  22.93 
 
 
212 aa  75.1  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  30.48 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>