168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1335 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  407  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  91.13 
 
 
203 aa  378  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  88.18 
 
 
203 aa  361  5e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  81.77 
 
 
218 aa  344  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  61.58 
 
 
203 aa  262  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2260  hypothetical protein  51.56 
 
 
207 aa  184  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0612695  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  52.63 
 
 
207 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  53.89 
 
 
206 aa  176  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  57.45 
 
 
227 aa  168  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  47.45 
 
 
202 aa  162  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  54.04 
 
 
201 aa  150  9e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  46.77 
 
 
203 aa  145  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  47.62 
 
 
201 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  47.06 
 
 
197 aa  129  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  43.89 
 
 
197 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  40.11 
 
 
197 aa  110  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  35.8 
 
 
187 aa  108  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.32173e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  43.53 
 
 
200 aa  106  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  42.07 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  41.22 
 
 
182 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  32.95 
 
 
187 aa  98.6  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  37.3 
 
 
203 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  33.87 
 
 
193 aa  95.5  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  37.17 
 
 
191 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  36.17 
 
 
188 aa  91.7  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  37.5 
 
 
183 aa  88.2  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  6.87112e-10  decreased coverage  6.9205e-08 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  33.9 
 
 
189 aa  87.8  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  33.15 
 
 
257 aa  87.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  32.26 
 
 
190 aa  86.3  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  32 
 
 
184 aa  85.5  5e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
191 aa  84  1e-15  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2609  hypothetical protein  36.36 
 
 
209 aa  84  1e-15  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00582159  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.14 
 
 
187 aa  83.6  2e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  35.43 
 
 
180 aa  83.6  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  35.81 
 
 
182 aa  83.2  2e-15  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  1.14136e-06 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5106  protein of unknown function DUF820  34.93 
 
 
186 aa  83.2  3e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  31.64 
 
 
200 aa  83.2  3e-15  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
198 aa  81.6  7e-15  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  33.54 
 
 
187 aa  80.9  1e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  31.35 
 
 
190 aa  78.6  6e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  32.02 
 
 
190 aa  78.2  8e-14  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
191 aa  78.2  8e-14  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1774  protein of unknown function DUF820  36.25 
 
 
186 aa  77.8  1e-13  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  33.85 
 
 
192 aa  77  2e-13  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  28.09 
 
 
181 aa  75.9  4e-13  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3913  protein of unknown function DUF820  30.98 
 
 
190 aa  75.1  6e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  35.63 
 
 
191 aa  75.1  6e-13  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  30.43 
 
 
193 aa  75.1  7e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  33.55 
 
 
241 aa  75.1  7e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.58134e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  29.69 
 
 
187 aa  75.1  7e-13  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  35.21 
 
 
245 aa  74.7  8e-13  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  34.97 
 
 
197 aa  73.9  1e-12  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  29.57 
 
 
191 aa  73.6  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  32.87 
 
 
253 aa  73.9  2e-12  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  3.09479e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  33.11 
 
 
242 aa  73.6  2e-12  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.23866e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  31.69 
 
 
189 aa  72.4  4e-12  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  5.57218e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  27.03 
 
 
192 aa  71.6  7e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  29.32 
 
 
193 aa  71.2  9e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.63106e-07  unclonable  1.37407e-10 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  31.35 
 
 
192 aa  71.2  1e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  40.74 
 
 
195 aa  70.1  2e-11  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  29.03 
 
 
185 aa  69.3  4e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  30.69 
 
 
184 aa  68.9  4e-11  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  34.44 
 
 
184 aa  67.4  1e-10  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  33.13 
 
 
218 aa  66.6  2e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  30.05 
 
 
202 aa  66.2  3e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  7.573e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  30.22 
 
 
251 aa  66.2  3e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.47 
 
 
244 aa  65.5  5e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  31.82 
 
 
207 aa  65.1  7e-10  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2526  hypothetical protein  37.68 
 
 
203 aa  64.3  1e-09  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206589  normal  0.745366 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  27.27 
 
 
193 aa  62  6e-09  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  28.35 
 
 
207 aa  61.2  9e-09  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  33.71 
 
 
199 aa  60.1  2e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.36885e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  34.12 
 
 
200 aa  60.1  2e-08  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  32.61 
 
 
204 aa  59.7  3e-08  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  59.7  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5079  protein of unknown function DUF820  34.09 
 
 
214 aa  58.5  6e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.581399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2224  hypothetical protein  32.33 
 
 
219 aa  58.5  6e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108334  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4399  hypothetical protein  30.99 
 
 
182 aa  58.2  7e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.722704  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  25.73 
 
 
188 aa  58.2  8e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  34.72 
 
 
186 aa  57.8  1e-07  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  25.15 
 
 
188 aa  56.6  2e-07  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  33.33 
 
 
204 aa  56.2  3e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0217  hypothetical protein  30.39 
 
 
186 aa  55.8  4e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.26 
 
 
195 aa  55.8  4e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  31.12 
 
 
195 aa  55.8  4e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  30.56 
 
 
205 aa  55.5  5e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2290  protein of unknown function DUF820  28.46 
 
 
126 aa  55.5  6e-07  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109681  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1327  protein of unknown function DUF820  30.25 
 
 
223 aa  54.7  9e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621558  normal  0.19062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  30.65 
 
 
205 aa  53.9  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1143  hypothetical protein  29.89 
 
 
189 aa  53.5  2e-06  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  30.83 
 
 
194 aa  52.8  3e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  32.28 
 
 
257 aa  53.1  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.45405e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  30.05 
 
 
186 aa  53.1  3e-06  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1211  protein of unknown function DUF820  31.55 
 
 
187 aa  52.4  4e-06  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  32.6 
 
 
233 aa  52.4  4e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  1.29313e-06  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3390  response regulator receiver protein  35.46 
 
 
197 aa  51.2  9e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  27.13 
 
 
215 aa  50.8  1e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  34.31 
 
 
205 aa  50.1  2e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  32.14 
 
 
205 aa  50.1  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  46.94 
 
 
203 aa  49.7  3e-05  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>