More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1328 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
332 aa  667    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  80 
 
 
330 aa  494  1e-139  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  58.39 
 
 
337 aa  350  2e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  48.78 
 
 
331 aa  286  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  41.22 
 
 
328 aa  191  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 
318 aa  188  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  36.08 
 
 
320 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
337 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  28.48 
 
 
320 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  37.01 
 
 
334 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 
345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
298 aa  123  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
366 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
313 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 
350 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  34.72 
 
 
838 aa  119  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.83 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
378 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
822 aa  116  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  32.01 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  36.57 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6342  glycosyl transferase family 2  35.68 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0272531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  32.45 
 
 
841 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
279 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
321 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  30 
 
 
338 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  30.25 
 
 
355 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
346 aa  107  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
302 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  32.02 
 
 
841 aa  108  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
324 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
401 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06130  predicted glycosyltransferase  34.6 
 
 
323 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134894  normal  0.704926 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
303 aa  106  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  33.74 
 
 
312 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
307 aa  105  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  28.86 
 
 
348 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0059  glycosyl transferase family 2  26.56 
 
 
335 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
315 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  32.92 
 
 
336 aa  104  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  30.68 
 
 
327 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  29.18 
 
 
336 aa  103  3e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  28.53 
 
 
358 aa  103  4e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
1340 aa  103  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 
343 aa  103  5e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
358 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  29.89 
 
 
836 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  30.28 
 
 
327 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  28.48 
 
 
308 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
308 aa  99.8  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.17 
 
 
310 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0843  hypothetical protein  25.16 
 
 
339 aa  99  9e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  30.15 
 
 
288 aa  99.4  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4185  glycosyl transferase family 2  29.46 
 
 
307 aa  99  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  30.58 
 
 
283 aa  99  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
298 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
360 aa  97.8  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.92 
 
 
325 aa  97.4  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
1523 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  29.22 
 
 
352 aa  96.7  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
282 aa  96.3  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
324 aa  95.9  8e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.63 
 
 
300 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  26.71 
 
 
337 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5500  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359708  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
353 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  32.16 
 
 
274 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 
313 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0818  hypothetical protein  24.52 
 
 
339 aa  94.4  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 
340 aa  93.2  5e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 
1523 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
337 aa  92.8  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
359 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.43 
 
 
652 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  32.71 
 
 
1162 aa  90.9  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  32.71 
 
 
284 aa  91.3  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.68 
 
 
355 aa  90.5  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  29.1 
 
 
328 aa  90.5  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0564  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  32.27 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
705 aa  89.7  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  31.74 
 
 
1268 aa  89.7  6e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.49 
 
 
339 aa  89.7  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
324 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
299 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
1435 aa  89  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  26.53 
 
 
305 aa  89  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>