189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1300 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2190  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  86.43 
 
 
2002 aa  3414    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2870  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.13 
 
 
2191 aa  1015    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  100 
 
 
2002 aa  3973    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64211  normal  0.760951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  35.34 
 
 
2195 aa  1004    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2207  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.26 
 
 
1916 aa  571  1e-161  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0907141  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0928  alpha-2-macroglobulin-like  27.45 
 
 
1559 aa  493  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258342 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1926  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.57 
 
 
1971 aa  475  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0638  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.83 
 
 
1872 aa  475  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.335883  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2138  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.76 
 
 
1821 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.977531  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2037  Alpha-2-macroglobulin-like protein2  28.86 
 
 
1974 aa  467  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.722352  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1841  alpha-2-macroglobulin domain protein  28.78 
 
 
1971 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1220  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.45 
 
 
1704 aa  387  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.260972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1300  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.49 
 
 
1737 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310712  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2227  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 
1953 aa  339  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.68 
 
 
2057 aa  337  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0303  alpha-2-macroglobulin-like  22.21 
 
 
1869 aa  323  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2357  Alpha-2-macroglobulin-like  22.31 
 
 
1906 aa  317  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0821687  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09660  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.39 
 
 
1823 aa  301  7e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1157  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.54 
 
 
1927 aa  285  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1565  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.16 
 
 
2125 aa  266  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3542  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.34 
 
 
1819 aa  238  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1097  large extracellular alpha-helical protein-like protein  26.45 
 
 
1748 aa  232  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000683737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0241  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.25 
 
 
1935 aa  230  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.516561 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0898  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.48 
 
 
2019 aa  227  2e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.852359  hitchhiker  0.00019816 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1193  hypothetical protein  21.76 
 
 
1807 aa  221  7.999999999999999e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0613973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2638  alpha-2-macroglobulin domain protein  26.21 
 
 
1785 aa  215  7e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.191671  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3939  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  26.92 
 
 
1757 aa  212  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1162  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.16 
 
 
1910 aa  199  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.434491  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1752  hypothetical protein  22.78 
 
 
1921 aa  199  6e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1811  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.66 
 
 
1534 aa  196  4e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0726728  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1757  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.03 
 
 
1534 aa  192  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000289734  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4444  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.35 
 
 
2013 aa  192  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5078  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.51 
 
 
1859 aa  190  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.364401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5749  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.15 
 
 
2022 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3813  alpha-2-macroglobulin-like  25 
 
 
2036 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.683754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4555  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25 
 
 
2036 aa  190  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.11517  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.19 
 
 
1663 aa  186  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.384695 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4092  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.38 
 
 
2013 aa  186  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1778  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.57 
 
 
1352 aa  183  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000145479  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3980  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  25.18 
 
 
2013 aa  182  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0975356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1291  Alpha-2-macroglobulin-like  24.85 
 
 
2019 aa  179  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.522086  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0715  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.43 
 
 
1708 aa  179  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0541  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.61 
 
 
1641 aa  177  2.9999999999999996e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3969  putative lipoprotein  22.27 
 
 
1665 aa  174  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0586  hypothetical protein  24.54 
 
 
1641 aa  171  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2771  YfhM  21.87 
 
 
1644 aa  170  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3531  alpha-2-macroglobulin-like protein  22.97 
 
 
1993 aa  170  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1127  alpha-2-macroglobulin family protein  24.85 
 
 
2050 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0785  hypothetical protein  24.95 
 
 
2055 aa  169  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.15169  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0681  hypothetical protein  24.95 
 
 
2055 aa  169  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2407  alpha-2-macroglobulin family protein  24.95 
 
 
2067 aa  169  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1583  alpha-2-macroglobulin family protein  23.91 
 
 
2064 aa  168  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2963  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.7 
 
 
1594 aa  168  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0778084 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1204  alpha-2-macroglobulin family protein  24.85 
 
 
2053 aa  168  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19066  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1749  alpha-2-macroglobulin family protein  25 
 
 
2057 aa  168  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0942  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.31 
 
 
2020 aa  168  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.802119 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0508  Alpha-2-macroglobulin-like large extracellular alpha-helical protein  23.99 
 
 
2002 aa  167  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.875206  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2790  hypothetical protein  21.75 
 
 
1644 aa  167  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3310  alpha-2-macroglobulin domain protein  24.79 
 
 
1594 aa  167  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0596632 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2727  hypothetical protein  21.77 
 
 
1644 aa  166  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2672  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.32 
 
 
1652 aa  165  7e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.757649  normal  0.278199 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2684  YfhM  21.7 
 
 
1646 aa  165  9e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1148  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.41 
 
 
1653 aa  164  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5000  Alpha-2-macroglobulin-like  24.01 
 
 
1521 aa  163  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.773426  normal  0.653227 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1157  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.4 
 
 
1653 aa  164  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.15132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0730  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.87 
 
 
1664 aa  164  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2671  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.4 
 
 
1653 aa  164  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02412  hypothetical protein  22.41 
 
 
1653 aa  163  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2382  alpha-2-macroglobulin-like protein  23.31 
 
 
1925 aa  163  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.465265 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02374  hypothetical protein  22.41 
 
 
1653 aa  163  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0108  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  21.49 
 
 
1619 aa  163  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3023  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.31 
 
 
1635 aa  162  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114034  normal  0.481242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2804  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.1 
 
 
1653 aa  161  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3749  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.22 
 
 
1653 aa  159  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3030  putative signal peptide protein  24.89 
 
 
1582 aa  159  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0044927  normal  0.201632 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2895  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.11 
 
 
1653 aa  157  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5147  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.57 
 
 
2000 aa  158  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2661  alpha-2-macroglobulin domain protein  25.28 
 
 
2006 aa  157  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.873515  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3234  alpha-2-macroglobulin-like  23.78 
 
 
2000 aa  157  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5134  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.78 
 
 
2000 aa  157  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3014  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.7 
 
 
1650 aa  157  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  25.33 
 
 
2016 aa  157  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5312  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.93 
 
 
1994 aa  156  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.729079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3921  hypothetical protein  23.26 
 
 
1839 aa  156  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.802641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0615  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.9 
 
 
1632 aa  155  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0451141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5103  hypothetical protein  24.02 
 
 
1516 aa  153  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3447  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.96 
 
 
1832 aa  153  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6005  alpha-2-macroglobulin domain protein  23.55 
 
 
1823 aa  152  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0337827 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1953  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.56 
 
 
2007 aa  152  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0156567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0570  alpha-2-macroglobulin domain protein  22.68 
 
 
1633 aa  152  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0604  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  23.69 
 
 
1824 aa  152  9e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0609  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.8 
 
 
1633 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4385  Alpha-2-macroglobulin, N-terminal:Alpha-2-macroglobulin, N-terminal  22.68 
 
 
1652 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4283  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.29 
 
 
1872 aa  150  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0071  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.29 
 
 
1872 aa  150  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.140868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3309  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  24.71 
 
 
2022 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.633759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4594  alpha-2-macroglobulin domain-containing protein  22.87 
 
 
1633 aa  149  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.144711 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3915  hypothetical protein  23.33 
 
 
1743 aa  148  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2191  alpha-2-macroglobulin domain protein  21.84 
 
 
1854 aa  147  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.466531  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1356  hypothetical protein  24.74 
 
 
1808 aa  147  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>