228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1283 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1283  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  331  3e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0530  hypothetical protein  93.33 
 
 
165 aa  315  2e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.323662  normal  0.444396 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4047  hypothetical protein  63.8 
 
 
164 aa  222  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1607  protein of unknown function DUF520  65.45 
 
 
165 aa  222  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.752652  normal  0.103946 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1708  putative nucleotide-binding protein  56.36 
 
 
165 aa  202  2e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2743  putative nucleotide-binding protein  59.39 
 
 
163 aa  199  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.192148 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0865  putative nucleotide-binding protein  60 
 
 
163 aa  197  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  normal  0.0156848 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0652  putative nucleotide-binding protein  55.76 
 
 
165 aa  195  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1379  putative nucleotide-binding protein  55.76 
 
 
163 aa  191  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.542697  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1813  putative nucleotide-binding protein  51.52 
 
 
165 aa  189  1e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0232218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2001  putative nucleotide-binding protein  55.15 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06941  putative nucleotide-binding protein  54.6 
 
 
176 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05371  putative nucleotide-binding protein  50.91 
 
 
165 aa  187  7e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.280334 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04811  putative nucleotide-binding protein  50.91 
 
 
165 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3306  hypothetical protein  53.94 
 
 
163 aa  182  2.0000000000000003e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0481  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
165 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05361  putative nucleotide-binding protein  47.27 
 
 
165 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05061  putative nucleotide-binding protein  46.67 
 
 
165 aa  171  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05441  putative nucleotide-binding protein  46.06 
 
 
165 aa  167  6e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.519943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1469  protein of unknown function DUF520  48.48 
 
 
164 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0438378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2028  putative nucleotide-binding protein  45.4 
 
 
164 aa  148  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1927  putative nucleotide-binding protein  43.37 
 
 
166 aa  147  9e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0682804  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21450  hypothetical protein  48.17 
 
 
162 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.000199035  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0876  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3073  putative nucleotide-binding protein  46.71 
 
 
163 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.760306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1273  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.152949  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1240  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1081  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1064  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1059  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1166  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1318  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2672  putative nucleotide-binding protein  44.91 
 
 
165 aa  133  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1213  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2696  protein of unknown function DUF520  44.31 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2778  putative nucleotide-binding protein  46.11 
 
 
163 aa  133  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00451374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3198  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4128  putative nucleotide-binding protein  43.64 
 
 
163 aa  132  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0619  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
161 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0491781  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0736  protein of unknown function DUF520  46.39 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0633  putative nucleotide-binding protein  41.82 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.897e-30 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0662  putative nucleotide-binding protein  42.77 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.103714  normal  0.990048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3093  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000935771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1061  putative nucleotide-binding protein  44.24 
 
 
163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000318846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3127  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  131  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.266318  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2474  putative nucleotide-binding protein  38.18 
 
 
161 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0278079 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0730  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
161 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5887  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
161 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2899  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 
161 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17650  putative nucleotide-binding protein  44.31 
 
 
162 aa  130  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.839683  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21350  hypothetical protein  44.05 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0391235  hitchhiker  0.000130122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2603  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
161 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10576  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.703775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3204  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118693  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0717  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000115495  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0997  putative nucleotide-binding protein  44.85 
 
 
163 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446557  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0373  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2760  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
161 aa  128  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1071  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3111  putative nucleotide-binding protein  37.58 
 
 
165 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000138147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0332  hypothetical protein  44.85 
 
 
163 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.408979  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0564  putative nucleotide-binding protein  46.39 
 
 
163 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0673  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2508  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0915  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.885973  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0919  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0122  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  128  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3206  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
161 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000932382  hitchhiker  2.6233800000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1044  putative nucleotide-binding protein  40.61 
 
 
161 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5091  protein of unknown function DUF520  44.31 
 
 
165 aa  127  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413017  normal  0.812219 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0784  protein of unknown function DUF520  41.92 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00367732  normal  0.156821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0858  protein of unknown function DUF520  43.37 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83182  hitchhiker  0.00457625 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1104  protein of unknown function DUF520  45.45 
 
 
163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.237734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1539  putative nucleotide-binding protein  40 
 
 
163 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6074  putative nucleotide-binding protein  43.29 
 
 
162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.21358 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2585  putative nucleotide-binding protein  41.21 
 
 
160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358565  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1196  putative nucleotide-binding protein  42.42 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.699154  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0977  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03430  hypothetical protein  43.98 
 
 
163 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.405869  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1091  protein of unknown function DUF520  40 
 
 
161 aa  125  3e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0508  protein of unknown function DUF520  42.42 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1846  putative nucleotide-binding protein  39.39 
 
 
161 aa  124  5e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10690  hypothetical protein  43.11 
 
 
165 aa  124  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0100552  unclonable  0.00000000113677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0777  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
179 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0791  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
179 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.20666 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0772  putative nucleotide-binding protein  43.03 
 
 
179 aa  124  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.596495  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2549  putative nucleotide-binding protein  36.97 
 
 
161 aa  123  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0690  nucleotide-binding protein  45.78 
 
 
164 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.310071 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2420  putative nucleotide-binding protein  36.36 
 
 
161 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1622  protein of unknown function DUF520  41.92 
 
 
165 aa  122  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00216659  hitchhiker  0.0000000173634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3188  protein of unknown function DUF520  42.26 
 
 
167 aa  122  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.171819  normal  0.0244342 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2671  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 
161 aa  122  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0558  putative nucleotide-binding protein  42.68 
 
 
162 aa  122  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0711  putative nucleotide-binding protein  38.79 
 
 
163 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000320146  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6653  putative nucleotide-binding protein  43.37 
 
 
163 aa  121  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.59339  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0959  hypothetical protein  43.03 
 
 
164 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3058  putative nucleotide-binding protein  40.12 
 
 
163 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309078 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2826  putative nucleotide-binding protein  35.76 
 
 
161 aa  120  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.931729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4374  protein of unknown function DUF520  41.46 
 
 
162 aa  120  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0379  protein of unknown function DUF520  42.26 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0120708  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>