More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1232 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1232  ABC transporter related  100 
 
 
355 aa  716    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.859211  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0795  ABC transporter related  86.99 
 
 
352 aa  576  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0764363  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  57.14 
 
 
342 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1173  ABC transporter related  56.89 
 
 
342 aa  350  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.317578  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2622  ABC transporter related  57.91 
 
 
346 aa  344  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3222  ABC transporter related  46.93 
 
 
378 aa  312  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0298457  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2724  ABC transporter related protein  49.57 
 
 
352 aa  305  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1278  ABC transporter related  46.84 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1756  ABC transporter related  49.41 
 
 
360 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1784  ABC transporter related  49.41 
 
 
360 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3222  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
387 aa  295  6e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2888  ABC transporter related  44.8 
 
 
360 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0605  ABC transporter related  45.95 
 
 
396 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2272  ABC transporter-like protein  47.81 
 
 
363 aa  291  8e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030703 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2275  ABC transporter related  45.8 
 
 
377 aa  290  4e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1406  ATPase  49.72 
 
 
368 aa  286  2.9999999999999996e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14020  ABC transporter, ATP binding component  47.26 
 
 
369 aa  285  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8128  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  49.85 
 
 
333 aa  280  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3510  ABC transporter related  44.92 
 
 
390 aa  280  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01314  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1429  ABC transporter related  49.28 
 
 
350 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000457261 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0734  ABC transporter related  44.02 
 
 
398 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0742  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  47.02 
 
 
349 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0472  ABC transporter related  51.86 
 
 
389 aa  272  8.000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.745799  normal  0.301247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002576  ferric iron ABC transporter ATP-binding protein  42.06 
 
 
343 aa  271  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3345  ABC transporter related  46.69 
 
 
349 aa  270  2e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0730  ABC transporter related  42.86 
 
 
357 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.533681  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0608  ABC transporter related  46.69 
 
 
349 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3515  ABC transporter related  46.69 
 
 
349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3670  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  45.18 
 
 
373 aa  268  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4826  ABC transporter related  45.71 
 
 
352 aa  268  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160742  normal  0.0580925 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  47.47 
 
 
349 aa  267  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
353 aa  267  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2864  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  46.34 
 
 
368 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1874  ABC transporter related  48.25 
 
 
378 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3815  ABC transporter related  49.29 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3691  ABC transporter related  49.29 
 
 
349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.484618  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  50.53 
 
 
352 aa  266  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
353 aa  266  5e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3633  ABC transporter related  49.29 
 
 
349 aa  266  5e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1100  ABC transporter related  43.45 
 
 
361 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2590  ABC transporter related  43.72 
 
 
369 aa  265  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3225  ABC transporter related  48.21 
 
 
349 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1960  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  43.53 
 
 
399 aa  264  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4528  ABC transporter-like  42.82 
 
 
369 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0603  ABC transporter related  48.93 
 
 
349 aa  264  2e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1083  ABC transporter related  47.99 
 
 
347 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.757107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0740  ABC transporter related  44.28 
 
 
353 aa  263  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.05 
 
 
353 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1588  ABC transporter related  44.72 
 
 
386 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2586  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  41.35 
 
 
346 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.8 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.50404 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03433  hypothetical protein  40.41 
 
 
343 aa  261  2e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2318  ABC transporter related  45.4 
 
 
358 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0300593  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  47.76 
 
 
360 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1270  ABC transporter related  43.49 
 
 
361 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.117767  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2102  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 
356 aa  260  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0781  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
349 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00618653  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0947  ABC transporter related  44.04 
 
 
342 aa  259  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  46.03 
 
 
348 aa  259  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3850  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.58 
 
 
356 aa  259  6e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.60669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0913  ABC transporter-related protein  46.53 
 
 
354 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3343  ABC transporter related  44 
 
 
368 aa  258  9e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1960  ABC transporter related  47.9 
 
 
349 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.256367  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4043  ABC transporter related  46.49 
 
 
353 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0310974  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1801  ABC transporter related  42.64 
 
 
375 aa  257  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00733059  normal  0.0241111 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1980  ABC transporter related  47.9 
 
 
349 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262332  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1062  ABC transporter related protein  48.04 
 
 
373 aa  257  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2695  ABC transporter related  52.92 
 
 
374 aa  258  2e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2026  ABC transporter related  47.9 
 
 
349 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0863  ABC transporter-related protein  42.9 
 
 
342 aa  256  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0433  ferric transporter ATP-binding subunit  47.75 
 
 
348 aa  257  3e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.59 
 
 
339 aa  256  4e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3482  ABC transporter related protein  44.13 
 
 
384 aa  256  4e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.815806  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4408  ABC transporter related  51.33 
 
 
373 aa  256  5e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.792188  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1935  ABC transporter related  47.52 
 
 
352 aa  256  6e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.35 
 
 
359 aa  256  6e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1590  ABC transporter related  42.97 
 
 
384 aa  255  7e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.408037  normal  0.431206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3005  ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 
350 aa  255  7e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.275238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2400  ABC putrescine transporter, ATPase subunit  50.17 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1837  ABC Fe+3 transporter, ATPase subunit  46.86 
 
 
352 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.332439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0289  ABC transporter ATP-binding protein  44.01 
 
 
370 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2841  ABC transporter related  44.08 
 
 
343 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.355371  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1197  ABC transporter related  43.84 
 
 
359 aa  253  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0998  ABC transporter related  46.62 
 
 
342 aa  253  3e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116627 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0831  ferric transporter ATP-binding subunit  47.87 
 
 
348 aa  253  4.0000000000000004e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0453  transport system ATP-binding protein  44.74 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5748  ABC transporter related  43.25 
 
 
364 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  50.35 
 
 
351 aa  253  5.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4843  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 
352 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.061822 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.23 
 
 
357 aa  252  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1119  ABC transporter related  45.02 
 
 
369 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209434  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2401  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.07 
 
 
355 aa  252  8.000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4165  ABC transporter, ATP-binding protein  42.82 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2137  ABC transporter related  47.81 
 
 
353 aa  252  8.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  48.08 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1107  ABC transporter related  45.32 
 
 
369 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1770  ferric transporter ATP-binding subunit  46.05 
 
 
349 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.299864  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1078  ABC transporter ATP-binding protein  44.82 
 
 
369 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0281  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 
354 aa  251  1e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4455  ABC transporter related  47.26 
 
 
369 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.044613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>