More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1198 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1198  patatin  100 
 
 		 394 aa  787    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0901523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2164  patatin  86.8 
 
 		 398 aa  684    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.22699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0065  Patatin  53.02 
 
 		 405 aa  371  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1144  patatin  50.84 
 
 		 411 aa  331  1e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1385  Patatin  47.57 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.858901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3528  patatin  35.58 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.372261  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0816  patatin  35.43 
 
 		 413 aa  209  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0488  alpha/beta fold family hydrolase  36.44 
 
 		 397 aa  207  3e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.30127  normal  0.0348857 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0775  patatin  27.95 
 
 		 351 aa  98.6  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5830  patatin  28.45 
 
 		 411 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  29.76 
 
 		 748 aa  79  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7582  Patatin  30.56 
 
 		 331 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1258  Patatin  34.82 
 
 		 283 aa  78.2  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0393654  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1045  Patatin  30.92 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0588831  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1777  patatin  32.81 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  25.96 
 
 		 740 aa  75.1  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  31.6 
 
 		 728 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  28.52 
 
 		 751 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2155  Patatin  31.87 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2063  Patatin  31.87 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3556  Patatin  26.97 
 
 		 331 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  28.57 
 
 		 728 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  28.2 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  31.47 
 
 		 728 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  27.71 
 
 		 667 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  28.69 
 
 		 767 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  30.8 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  28.33 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2029  patatin  32.57 
 
 		 288 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.209272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  26.67 
 
 		 741 aa  67  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  29.69 
 
 		 920 aa  67  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11080  hypothetical protein  32.37 
 
 		 294 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000671536  normal  0.268784 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  29.69 
 
 		 930 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  29.69 
 
 		 728 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  29.69 
 
 		 933 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  29.69 
 
 		 945 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4688  patatin  31.51 
 
 		 288 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4393  patatin  33.05 
 
 		 301 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4237  patatin  33.05 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.228516 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  28.99 
 
 		 804 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0848  patatin  30.3 
 
 		 377 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785224 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2141  patatin  28.51 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000481175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4171  patatin  33.05 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.520167  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  30.8 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  29.15 
 
 		 852 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1218  patatin  45 
 
 		 288 aa  64.7  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0148109 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  28.34 
 
 		 798 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  28.57 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  29.39 
 
 		 733 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  28.57 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  28.57 
 
 		 803 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  25.53 
 
 		 720 aa  63.2  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1697  patatin  28.63 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1237  patatin  30.16 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.880366  normal  0.614167 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  28.34 
 
 		 796 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  29.37 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  28.23 
 
 		 813 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  29.05 
 
 		 714 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2802  Patatin  26.26 
 
 		 256 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0035  Patatin  26.58 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.488757  hitchhiker  0.0000189708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0044  Patatin  31.7 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1891  patatin  28.81 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.358546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  27.66 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  27.98 
 
 		 777 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1627  Patatin  27.24 
 
 		 250 aa  61.2  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.999239  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  28.15 
 
 		 875 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  26.84 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  25.72 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1594  patatin-like phospholipase family protein  23.82 
 
 		 383 aa  60.5  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.845479  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  26.45 
 
 		 740 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  23.81 
 
 		 374 aa  60.5  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  31.62 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3091  patatin  26.85 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0120977  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1884  hypothetical protein  30.52 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0335  patatin  31.32 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172701 
 
 
-
 
NC_004310  BR1077  hypothetical protein  27.39 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  25 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1043  hypothetical protein  27.39 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.175435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  25.27 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  25 
 
 		 374 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  25 
 
 		 383 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3249  patatin  28.27 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2395  patatin  30.86 
 
 		 391 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.569331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  31.76 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1505  putative exported phospholipase  30.64 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000365604  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  31.33 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4813  Patatin  29.51 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.985393 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1434  patatin  32.58 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  29.08 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  31.33 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1079  Patatin  26.07 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0128373  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22060  hypothetical protein  30.12 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0545767  hitchhiker  7.20357e-19 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2615  patatin  25.44 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  28.19 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1840  Patatin  28.07 
 
 		 900 aa  58.2  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0621  patatin  29.05 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  26.67 
 
 		 760 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  25.57 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  25.57 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4052  patatin  25.95 
 
 		 375 aa  57.4  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>