More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1195 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
269 aa  549  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  85.94 
 
 
250 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  53.63 
 
 
249 aa  265  8e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  48.75 
 
 
250 aa  221  1e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  36.29 
 
 
140 aa  93.6  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.25 
 
 
151 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.97 
 
 
141 aa  89.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 
570 aa  87.8  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.31 
 
 
135 aa  86.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
138 aa  85.9  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
139 aa  84  3e-15  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  35.94 
 
 
142 aa  82.4  6e-15  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.09 
 
 
135 aa  82  8e-15  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.44 
 
 
136 aa  79  8e-14  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.84 
 
 
143 aa  78.6  1e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  32.09 
 
 
143 aa  76.6  4e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
138 aa  74.3  2e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
139 aa  74.7  2e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.38 
 
 
147 aa  74.7  2e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.89 
 
 
137 aa  73.9  3e-12  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.38 
 
 
792 aa  72.4  8e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.62 
 
 
155 aa  72.4  8e-12  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  27.07 
 
 
563 aa  71.6  1e-11  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  33.59 
 
 
160 aa  71.2  2e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
141 aa  70.9  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  33.59 
 
 
160 aa  71.2  2e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  33.59 
 
 
160 aa  71.2  2e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  35.82 
 
 
777 aa  70.9  2e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
142 aa  70.5  3e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  32.82 
 
 
160 aa  69.7  5e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  32.82 
 
 
160 aa  69.3  6e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2441  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.59 
 
 
138 aa  69.3  6e-11  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  32.82 
 
 
160 aa  69.3  7e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.81084e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  30.58 
 
 
133 aa  69.3  7e-11  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  32.82 
 
 
160 aa  69.3  7e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 
141 aa  68.6  1e-10  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  32.06 
 
 
160 aa  67.8  2e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  37.89 
 
 
118 aa  67.8  2e-10  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  30.93 
 
 
117 aa  67.8  2e-10  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 
111 aa  67  3e-10  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.77 
 
 
134 aa  66.6  4e-10  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  32.61 
 
 
110 aa  66.6  5e-10  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 
136 aa  66.2  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  32.06 
 
 
160 aa  66.2  5e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  31.88 
 
 
152 aa  66.2  5e-10  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  32.06 
 
 
160 aa  66.2  5e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  40.22 
 
 
111 aa  65.9  7e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.00859e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1087  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
141 aa  65.5  8e-10  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  29.84 
 
 
143 aa  65.1  1e-09  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.1 
 
 
492 aa  63.9  2e-09  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  36.47 
 
 
108 aa  64.7  2e-09  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2188  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
142 aa  64.3  2e-09  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  35.78 
 
 
110 aa  64.7  2e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2057  anti-anti-sigma factor  42.86 
 
 
117 aa  64.3  2e-09  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
108 aa  64.7  2e-09  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  35.48 
 
 
109 aa  63.5  4e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  4.18281e-05  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.58 
 
 
143 aa  63.2  4e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.33 
 
 
129 aa  62.8  5e-09  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3706  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.35 
 
 
133 aa  62.8  5e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0345536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  36.96 
 
 
113 aa  63.2  5e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 
116 aa  62.4  8e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  33.7 
 
 
116 aa  62  1e-08  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  36.59 
 
 
111 aa  61.6  1e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
111 aa  61.2  2e-08  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  32.63 
 
 
110 aa  60.8  2e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0920  anti-sigma-factor antagonist  32.58 
 
 
115 aa  61.2  2e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.548618  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
121 aa  60.8  2e-08  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  33.05 
 
 
111 aa  60.8  2e-08  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  38.1 
 
 
162 aa  60.5  3e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  33.7 
 
 
111 aa  60.5  3e-08  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  35.87 
 
 
113 aa  60.1  4e-08  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3649  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 
109 aa  60.1  4e-08  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.78 
 
 
113 aa  59.7  5e-08  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07887e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1423  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
116 aa  59.3  6e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1567  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  40.24 
 
 
112 aa  59.3  6e-08  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.329396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  30.99 
 
 
885 aa  59.3  6e-08  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  30.25 
 
 
159 aa  58.9  7e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  30.25 
 
 
159 aa  58.9  7e-08  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 
111 aa  58.5  1e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  34.78 
 
 
111 aa  58.5  1e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  35.29 
 
 
116 aa  58.2  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  33.68 
 
 
111 aa  58.5  1e-07  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 
116 aa  58.5  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.09 
 
 
148 aa  58.5  1e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 
495 aa  57.8  2e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  28.47 
 
 
159 aa  57.4  2e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  30 
 
 
134 aa  57.4  2e-07  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
137 aa  57.4  2e-07  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0177  hypothetical protein  27.4 
 
 
147 aa  57.8  2e-07  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.160815  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  38.16 
 
 
170 aa  57.8  2e-07  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  37.84 
 
 
113 aa  57.4  2e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  29.47 
 
 
110 aa  57  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2672  anti-sigma-factor antagonist  36.78 
 
 
122 aa  57.4  3e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2527  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.97 
 
 
147 aa  57  3e-07  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.557848  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2860  anti-sigma-factor antagonist  34.41 
 
 
113 aa  57  3e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.52 
 
 
112 aa  56.6  4e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  31.52 
 
 
112 aa  56.6  4e-07  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  36.49 
 
 
113 aa  56.6  4e-07  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  31.31 
 
 
142 aa  56.6  5e-07  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2101  anti-sigma-factor antagonist  33.7 
 
 
111 aa  55.8  6e-07  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>