More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1126 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  93.96 
 
 		 414 aa  714    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  801    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  72.05 
 
 		 415 aa  561  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  43.07 
 
 		 409 aa  311  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.97 
 
 		 405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  43.83 
 
 		 409 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  42.89 
 
 		 407 aa  296  5e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  42.17 
 
 		 405 aa  292  9e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  42.11 
 
 		 443 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  43.86 
 
 		 405 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 406 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  41.45 
 
 		 409 aa  288  1e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  41.63 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  40.72 
 
 		 405 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 		 405 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  39.42 
 
 		 410 aa  282  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  39.42 
 
 		 410 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  40.44 
 
 		 409 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  40.44 
 
 		 409 aa  280  5e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  40.39 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  41.16 
 
 		 409 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  39.71 
 
 		 398 aa  278  2e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  40.38 
 
 		 658 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  44.34 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  41.45 
 
 		 405 aa  273  3e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  39.76 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  40.95 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  39.19 
 
 		 406 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  40.8 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  40.1 
 
 		 401 aa  266  4e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  37.38 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  39.61 
 
 		 653 aa  260  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  40.62 
 
 		 402 aa  260  4e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  38.61 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.71 
 
 		 412 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  36.41 
 
 		 406 aa  257  2e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  39.76 
 
 		 400 aa  256  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  39.19 
 
 		 411 aa  255  9e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  37.65 
 
 		 656 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  41.25 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  38.66 
 
 		 410 aa  254  2.0000000000000002e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  39.66 
 
 		 657 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  38.65 
 
 		 403 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  38.83 
 
 		 412 aa  253  6e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  40.19 
 
 		 410 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  37.68 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  40.14 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 		 406 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  40.14 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  37.11 
 
 		 651 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  36.59 
 
 		 657 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  37.2 
 
 		 644 aa  244  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  38.04 
 
 		 409 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  39.52 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  37.35 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  38.89 
 
 		 400 aa  241  2e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  36.67 
 
 		 657 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  40.38 
 
 		 403 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  39.76 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  37.14 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  39.61 
 
 		 392 aa  239  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 409 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.74 
 
 		 652 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 		 409 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  35.23 
 
 		 456 aa  236  6e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  39.34 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  40 
 
 		 409 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.62 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  37.02 
 
 		 409 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  38.77 
 
 		 402 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  36.5 
 
 		 670 aa  233  6e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  37.17 
 
 		 423 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  38.05 
 
 		 400 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  39.18 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  38.77 
 
 		 409 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  39.43 
 
 		 661 aa  232  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  39.81 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  37.91 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  35.7 
 
 		 715 aa  231  2e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  35.18 
 
 		 394 aa  230  4e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  38.76 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  38.94 
 
 		 671 aa  229  7e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  39.32 
 
 		 400 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.22 
 
 		 663 aa  229  9e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  39.49 
 
 		 417 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  36.71 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  38.77 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  38.77 
 
 		 401 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.22 
 
 		 663 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  36.39 
 
 		 654 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.73 
 
 		 394 aa  225  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  36.11 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  36.34 
 
 		 648 aa  224  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  41.67 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  35.22 
 
 		 402 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  37.85 
 
 		 400 aa  224  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  37.65 
 
 		 397 aa  220  3e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>