More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1110 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0953  copper-translocating P-type ATPase  40.57 
 
 
828 aa  657    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3413  copper-translocating P-type ATPase  68.66 
 
 
849 aa  724    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0512645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  42.6 
 
 
837 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  44.55 
 
 
750 aa  673    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1110  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
938 aa  1875    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0214095  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4326  copper-translocating P-type ATPase  60.52 
 
 
837 aa  642    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000547057  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3774  heavy metal translocating P-type ATPase  78.02 
 
 
885 aa  1386    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1307  copper-translocating P-type ATPase  43.41 
 
 
758 aa  635  1e-180  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1754  heavy metal translocating P-type ATPase  40.6 
 
 
851 aa  622  1e-176  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2388  heavy-metal transporting P-type ATPase  42.39 
 
 
819 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.168329  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0143  heavy metal translocating P-type ATPase  40.78 
 
 
871 aa  616  1e-175  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  42.1 
 
 
905 aa  597  1e-169  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1994  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
857 aa  593  1e-168  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000675494  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  44.53 
 
 
1071 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2692  heavy metal translocating P-type ATPase  39.44 
 
 
887 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0975857 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  38.48 
 
 
976 aa  570  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
759 aa  550  1e-155  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2091  copper-translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
750 aa  542  1e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6008  heavy metal translocating P-type ATPase  46.81 
 
 
804 aa  535  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.930349 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9859  copper-translocating P-type ATPase  42.43 
 
 
737 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4911  heavy metal translocating P-type ATPase  44.85 
 
 
793 aa  534  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1397  hypothetical protein  43 
 
 
735 aa  530  1e-149  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0191  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
837 aa  528  1e-148  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.562672  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3052  heavy metal translocating P-type ATPase  38.44 
 
 
866 aa  522  1e-146  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4630  copper-translocating P-type ATPase  41.08 
 
 
801 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0746  copper-translocating P-type ATPase  48.42 
 
 
815 aa  521  1e-146  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000116614  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4380  copper-translocating P-type ATPase  41.21 
 
 
818 aa  518  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2020  heavy metal translocating P-type ATPase  40.3 
 
 
809 aa  518  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  48.78 
 
 
803 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  46.86 
 
 
797 aa  512  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1849  heavy metal translocating P-type ATPase  40.25 
 
 
762 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.191422  hitchhiker  0.000000000440646 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
816 aa  501  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4302  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 
815 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0264  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 
815 aa  499  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3420  heavy metal translocating P-type ATPase  40.7 
 
 
815 aa  499  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0301  heavy metal translocating P-type ATPase  38.62 
 
 
806 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0708  heavy metal translocating P-type ATPase  42.33 
 
 
736 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  46.22 
 
 
817 aa  490  1e-137  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2307  copper-translocating P-type ATPase  41.13 
 
 
783 aa  492  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  47.8 
 
 
797 aa  492  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  48.27 
 
 
798 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0129  copper-translocating P-type ATPase  48.62 
 
 
837 aa  488  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  46.52 
 
 
805 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3434  heavy metal translocating P-type ATPase  42.21 
 
 
833 aa  484  1e-135  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  47.77 
 
 
836 aa  485  1e-135  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5378  heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
761 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.269135 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2142  heavy metal translocating P-type ATPase  42.32 
 
 
781 aa  482  1e-134  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.000033244  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  47.27 
 
 
838 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10677  P1B, P type ATPase  34.23 
 
 
883 aa  479  1e-133  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.704376  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01268  cation transport ATPase  35.15 
 
 
898 aa  478  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1058  heavy metal translocating P-type ATPase  40.34 
 
 
754 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2276  heavy metal translocating P-type ATPase  49.44 
 
 
801 aa  478  1e-133  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1813  copper-translocating P-type ATPase  35.91 
 
 
800 aa  477  1e-133  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2633  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
802 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.881723  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2579  copper-translocating P-type ATPase  46.36 
 
 
802 aa  475  1e-132  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4609  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
786 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1835  heavy metal translocating P-type ATPase  38.38 
 
 
804 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3533  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
786 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1871  heavy metal translocating P-type ATPase  33.16 
 
 
866 aa  474  1e-132  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000734074  normal  0.315442 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  37.81 
 
 
868 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  47.43 
 
 
821 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3191  copper-translocating P-type ATPase  37 
 
 
760 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.427707  normal  0.767066 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1499  copper-translocating P-type ATPase  38.77 
 
 
744 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2846  copper-translocating P-type ATPase  38.65 
 
 
744 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.515584  hitchhiker  0.000113532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2587  copper-translocating P-type ATPase  37.36 
 
 
758 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0901243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1485  copper-translocating P-type ATPase  37.24 
 
 
752 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.391625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1505  copper-translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
744 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  46.52 
 
 
805 aa  464  1e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  46.57 
 
 
806 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2131  cation transporter E1-E2 family ATPase  43.93 
 
 
794 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  46.2 
 
 
806 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0182  copper-translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
798 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365943  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  46.15 
 
 
805 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  46.15 
 
 
805 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  46.04 
 
 
794 aa  462  9.999999999999999e-129  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0280  copper-translocating P-type ATPase  47.06 
 
 
798 aa  462  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1535  copper-translocating P-type ATPase  38.42 
 
 
744 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.639562  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  46.15 
 
 
806 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  46.15 
 
 
805 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21370  copper/silver-translocating P-type ATPase  40.29 
 
 
819 aa  461  9.999999999999999e-129  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.770676  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0296  heavy metal translocating P-type ATPase  47.15 
 
 
826 aa  462  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2654  copper-translocating P-type ATPase  37.44 
 
 
758 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2761  copper-translocating P-type ATPase  36.87 
 
 
753 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  47.47 
 
 
836 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3445  heavy metal translocating P-type ATPase  40.06 
 
 
868 aa  456  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0136412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  45.79 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  48.11 
 
 
753 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  45.79 
 
 
805 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0612  copper-translocating P-type ATPase  43.33 
 
 
942 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.764101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1408  copper-translocating P-type ATPase  37.78 
 
 
744 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.659936  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  50.28 
 
 
790 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0089  ATPase, P type cation/copper-transporter  47.01 
 
 
833 aa  452  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  48.98 
 
 
752 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_824  cation transport ATPase  43.11 
 
 
828 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21010  copper-translocating P-type ATPase  48 
 
 
829 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.559491  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  46.21 
 
 
793 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  44.7 
 
 
799 aa  449  1.0000000000000001e-124  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1640  P1 ATPase/HMA domain-containing protein  48.05 
 
 
817 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0650256 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0837  heavy metal translocating P-type ATPase  36.66 
 
 
828 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  44.26 
 
 
796 aa  446  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>