17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1065 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1065  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0420  hypothetical protein  77.48 
 
 		 236 aa  254  8e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159781 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3408  hypothetical protein  37.07 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.316988  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3409  hypothetical protein  36.21 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.186244  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1520  hypothetical protein  33.57 
 
 		 261 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.110236 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  26.34 
 
 		 231 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0118  hypothetical protein  30.17 
 
 		 254 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.383113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  28.81 
 
 		 248 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  31.36 
 
 		 250 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  28.12 
 
 		 402 aa  42.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1198  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 		 217 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  26.47 
 
 		 376 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  26.5 
 
 		 217 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  29.31 
 
 		 274 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>