227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1055 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1055  deaminase-reductase domain-containing protein  100 
 
 		 175 aa  356  7e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.530435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4000  bifunctional deaminase-reductase domain protein  53.14 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1819  hypothetical protein  38.01 
 
 		 194 aa  114  6e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.760662  normal  0.208033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.83 
 
 		 178 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4321  bifunctional deaminase-reductase-like  34.68 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6691  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.08 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.24 
 
 		 180 aa  104  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 		 181 aa  104  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6250  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.83 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3728  deaminase-reductase domain-containing protein  35.68 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.98 
 
 		 185 aa  93.6  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4109  deaminase-reductase domain-containing protein  36.41 
 
 		 195 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0444635 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1348  bifunctional deaminase-reductase-like protein  30.41 
 
 		 174 aa  90.1  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1257  hypothetical protein  32.37 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0685  dihydrofolate reductase family protein  29.63 
 
 		 173 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0926552  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1572  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  36.31 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.476036  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1303  deaminase-reductase domain-containing protein  37.29 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522678  normal  0.528809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0563  deaminase-reductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0560  dihydrofolate reductase family protein  28.92 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.95 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0109  riboflavin biosynthesis protein RibD domain-containing protein  28.93 
 
 		 191 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4653  dihydrofolate reductase family protein  28.4 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000227287  unclonable  3.28669e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0616  dihydrofolate reductase family protein  28.92 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0649  dihydrofolate reductase family protein  28.92 
 
 		 173 aa  81.3  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.64296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0706  dihydrofolate reductase family protein  28.48 
 
 		 173 aa  80.9  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0717  dihydrofolate reductase family protein  28.31 
 
 		 173 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0561  dihydrofolate reductase family protein  28.92 
 
 		 173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.502278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0778  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.31 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  31.82 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2516  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.93 
 
 		 189 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.367324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5023  deaminase-reductase domain-containing protein  31 
 
 		 198 aa  77.4  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.499982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1707  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.94 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00260844  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1658  hypothetical protein  31.79 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.75 
 
 		 199 aa  74.3  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1460  deaminase-reductase domain-containing protein  30.1 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00400917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1365  deaminase-reductase domain-containing protein  25.56 
 
 		 173 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  24.74 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  26.92 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0223  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.95 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  25.27 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3753  deaminase-reductase domain-containing protein  30.65 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4561  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.99 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1297  dihydrofolate reductase family protein  28.09 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0107398  normal  0.520158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2972  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.39 
 
 		 193 aa  70.9  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14470  dihydrofolate reductase  29.41 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2942  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.11 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19210  hypothetical protein  30.68 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.78523 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.98 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  28.73 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.57 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2202  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.79 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.267992  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3207  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.17 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.535635  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  28.49 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  29.44 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1194  deaminase-reductase domain-containing protein  27.32 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3169  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.0042586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1367  deaminase-reductase domain-containing protein  30.11 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2049  bifunctional deaminase-reductase-like  33.57 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.42 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.03 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.02 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.81 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2061  deaminase-reductase domain-containing protein  28.57 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0213249  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0205  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.42 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  26.67 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05290  dihydrofolate reductase  30.43 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0215  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.42 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0225  deaminase-reductase domain-containing protein  26.42 
 
 		 177 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4077  dihydrofolate reductase  28.67 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3970  deaminase-reductase domain-containing protein  26.82 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  29.82 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  28.57 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2640  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  27.59 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.437336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0431  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.9 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.286458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.05 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  29.53 
 
 		 181 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3108  deaminase-reductase domain-containing protein  30.34 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0380037  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1969  hypothetical protein  26.23 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1963  hypothetical protein  26.23 
 
 		 181 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2306  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.26 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0916856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.68 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  27.03 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5690  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.172276  normal  0.519116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4096  RibD domain protein  32.53 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.894169  normal  0.813466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  27.81 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3354  deaminase-reductase domain-containing protein  26.38 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.622468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  29.53 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14580  dihydrofolate reductase  27.68 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  28.35 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.78 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  29.28 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  26.26 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  26.26 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.98 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6294  bifunctional deaminase-reductase-like  28.41 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1785  deaminase-reductase domain-containing protein  28.41 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>