More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0989 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0989  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3811  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  88.53 
 
 
218 aa  399  1e-110  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0258  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  58.57 
 
 
217 aa  218  4e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3266  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.69 
 
 
219 aa  213  1e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2838  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.49 
 
 
225 aa  213  2e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  57.21 
 
 
219 aa  211  5e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.827689  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1929  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.42 
 
 
680 aa  210  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.329265  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6264  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.78 
 
 
247 aa  209  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.34405 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1394  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.63 
 
 
220 aa  209  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1427  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.09 
 
 
217 aa  208  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2411e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1616  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.25 
 
 
219 aa  208  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0577413  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1925  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.31 
 
 
224 aa  208  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32328  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1069  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.78 
 
 
667 aa  205  3e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2831  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.88 
 
 
232 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3331  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.4 
 
 
236 aa  205  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.30408e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0318  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.37 
 
 
215 aa  201  6e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.975543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2480  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.29 
 
 
214 aa  201  6e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1901  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.3 
 
 
213 aa  201  8e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0370891  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1420  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  49.07 
 
 
216 aa  200  2e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00081136  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6438  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.47 
 
 
394 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.204863 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0906  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  55.88 
 
 
665 aa  196  2e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.266442  normal  0.140233 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2355  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.36 
 
 
220 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2618  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.52 
 
 
217 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  7.59722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4048  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.09 
 
 
660 aa  195  4e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0474  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.21 
 
 
219 aa  194  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.462994 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0447  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  56.81 
 
 
245 aa  194  8e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.522116  normal  0.950445 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1524  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.44 
 
 
216 aa  194  9e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2056  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.23 
 
 
666 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1086  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.47 
 
 
217 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00685852  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5912  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
657 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1556  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.97 
 
 
206 aa  192  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0186  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.76 
 
 
428 aa  191  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  4.67688e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2790  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.22 
 
 
244 aa  190  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2473  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.38 
 
 
222 aa  190  1e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1546  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  51.32 
 
 
219 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51 
 
 
223 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3032  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
222 aa  190  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2864  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.83 
 
 
247 aa  189  3e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.444402  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2225  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.89 
 
 
220 aa  188  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.33 
 
 
221 aa  187  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2684  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50 
 
 
206 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2738  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.15 
 
 
215 aa  186  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.101147  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1928  L-isoaspartyl protein carboxyl methyltransferase (protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)  44.71 
 
 
221 aa  185  4e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.731042  normal  0.421823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0265  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.47 
 
 
233 aa  182  2e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09538  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.78 
 
 
213 aa  182  3e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.381398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2850  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.52 
 
 
216 aa  181  6e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.104765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4121  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.5 
 
 
306 aa  181  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.879301  normal  0.299077 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0135  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.85 
 
 
206 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5883  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.65 
 
 
218 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4629  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.33 
 
 
216 aa  179  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0802433  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2077  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.64 
 
 
213 aa  179  3e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  6.01423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2730  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.05 
 
 
216 aa  179  3e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4262  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  53.85 
 
 
228 aa  178  5e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.207486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0380  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.61 
 
 
240 aa  178  6e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0638202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0151  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.87 
 
 
236 aa  176  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0412  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  49.28 
 
 
215 aa  176  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0252125 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2508  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.53 
 
 
208 aa  176  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1923  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  45.07 
 
 
222 aa  176  2e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4285  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.23 
 
 
217 aa  175  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1127  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.89 
 
 
223 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1903  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.88 
 
 
213 aa  174  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.486283 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002514  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.48 
 
 
208 aa  174  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4278  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.4 
 
 
211 aa  174  1e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1734  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.72 
 
 
216 aa  174  1e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4779  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  54.87 
 
 
212 aa  174  1e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0565845  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3446  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  42.21 
 
 
213 aa  173  2e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0335  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.19 
 
 
234 aa  172  4e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.570777 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1190  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.78 
 
 
213 aa  172  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  8.33235e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0060  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.48 
 
 
208 aa  171  6e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1430  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.14 
 
 
220 aa  171  7e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1280  protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase  50 
 
 
684 aa  171  7e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65747  normal  0.248461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1313  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  48.98 
 
 
197 aa  171  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000117774  decreased coverage  0.000182851 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1354  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  48.13 
 
 
245 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.697217 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0742  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.32 
 
 
199 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  7.68937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1515  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.63 
 
 
222 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0147  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  51.01 
 
 
227 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2892  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  52.36 
 
 
219 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.640231  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03519  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.47 
 
 
208 aa  169  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0830  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.86 
 
 
208 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.83 
 
 
228 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4414  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  50.96 
 
 
219 aa  168  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495598  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1682  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  43.22 
 
 
198 aa  169  4e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0422878  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3044  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3131  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0945  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134508  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0969  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.533941  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02558  hypothetical protein  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2868  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0339  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  44.23 
 
 
216 aa  168  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.104411  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3994  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2881  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02593  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.26 
 
 
208 aa  168  5e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17460  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  47.03 
 
 
211 aa  168  7e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1042  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  48.17 
 
 
211 aa  167  8e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2145  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  45.41 
 
 
221 aa  167  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3236  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.77 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3051  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.77 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3132  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.77 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.146098 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3116  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.77 
 
 
208 aa  166  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.184656  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1372  protein-L-isoaspartate O-methyltransferase  46.63 
 
 
225 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.12772  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>