71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0859 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  546  1e-154  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  79.08 
 
 
255 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  46.31 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  42.55 
 
 
261 aa  212  5.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  42.13 
 
 
261 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  45.49 
 
 
252 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  43.46 
 
 
252 aa  195  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  41.15 
 
 
262 aa  191  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  43.57 
 
 
254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  40.08 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  44.76 
 
 
252 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  41.06 
 
 
264 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  42.26 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  38.21 
 
 
247 aa  170  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  41.67 
 
 
243 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  38.21 
 
 
247 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  39.57 
 
 
254 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  37.3 
 
 
251 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  37.3 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  39.57 
 
 
246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  38.72 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  38.72 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  36.95 
 
 
266 aa  161  9e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  40.17 
 
 
261 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  36.82 
 
 
253 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  36.55 
 
 
251 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  37.45 
 
 
254 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  36.55 
 
 
251 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  36.07 
 
 
251 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  36.17 
 
 
268 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  36.07 
 
 
251 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  37.45 
 
 
255 aa  149  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  36.25 
 
 
251 aa  149  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  35.42 
 
 
251 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  38.91 
 
 
268 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  37.87 
 
 
262 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  39.13 
 
 
241 aa  141  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  39.13 
 
 
241 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  34.68 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  34.68 
 
 
258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  32.64 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  36.05 
 
 
257 aa  125  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  41.9 
 
 
235 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  34.44 
 
 
167 aa  93.6  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  34.44 
 
 
158 aa  93.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  33.33 
 
 
167 aa  90.9  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  28.92 
 
 
176 aa  78.2  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  33.12 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  32.05 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  33.55 
 
 
149 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  30.95 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  35.14 
 
 
155 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  31.11 
 
 
179 aa  63.5  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  27.56 
 
 
164 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  31.72 
 
 
145 aa  61.6  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  31.06 
 
 
164 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  28.38 
 
 
164 aa  60.1  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  30.82 
 
 
158 aa  58.5  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  27.56 
 
 
158 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  31.97 
 
 
153 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  31.79 
 
 
148 aa  56.6  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  33.56 
 
 
176 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  28.29 
 
 
180 aa  52.8  0.000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  32.19 
 
 
193 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  31.72 
 
 
126 aa  48.9  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  29.05 
 
 
162 aa  45.4  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48873  predicted protein  25.79 
 
 
808 aa  44.3  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.424343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  42.37 
 
 
167 aa  44.3  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0253  molybdopterin converting factor-like protein  42.86 
 
 
74 aa  43.9  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  26.28 
 
 
136 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0988512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>