More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0801 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0801  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
388 aa  767    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  72.22 
 
 
428 aa  556  1e-157  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2468  glycosyl transferase group 1  60.57 
 
 
386 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.822544  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4880  glycosyl transferase group 1  48.02 
 
 
393 aa  286  5.999999999999999e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3439  glycosyl transferase group 1  39.75 
 
 
400 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.359579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1419  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.42 
 
 
396 aa  263  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  41.52 
 
 
398 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3504  glycosyl transferase group 1  39.25 
 
 
400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0009700000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 
402 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1098  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 
399 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000174452 
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.69 
 
 
382 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1866  Phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  26.72 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2570  glycosyl transferase group 1  29.95 
 
 
402 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  26.09 
 
 
382 aa  88.2  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
390 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 
390 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  23.97 
 
 
373 aa  87  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0869  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.7 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000612209  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.72 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1294  glycosyl transferase  35.47 
 
 
379 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  30.54 
 
 
360 aa  82.8  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.19 
 
 
413 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2246  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.21 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.638485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2293  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.21 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.387023  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 
374 aa  78.6  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2285  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  28.21 
 
 
374 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 
391 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  29.56 
 
 
415 aa  77.8  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 
409 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.19 
 
 
360 aa  77  0.0000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  33.79 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3180  glycosyl transferase, group 1  22.68 
 
 
409 aa  77  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.780891  normal  0.107104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1526  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00489758  normal  0.775583 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50356  glycosyl transferase, group 1  24.81 
 
 
507 aa  76.3  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
396 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  26.8 
 
 
387 aa  74.7  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  31.14 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4843  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000641905  normal  0.0482294 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2607  glycosyl transferase group 1  29.73 
 
 
387 aa  74.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0762323  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
404 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1581  glycosyl transferase, group 1  24.04 
 
 
359 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  30.98 
 
 
377 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2620  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  29.12 
 
 
385 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1181  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 
419 aa  73.9  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0969  glycosyl transferase, group 1  25.96 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0289786  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  33.54 
 
 
423 aa  73.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1062  glycosyl transferase group 1  34.42 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3892  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 
408 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 
403 aa  73.2  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0232  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
397 aa  72.8  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000273015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  29.44 
 
 
353 aa  72.4  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0787  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 
417 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1787  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 
401 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0817969  normal  0.0689029 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  28.98 
 
 
346 aa  71.6  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  33.33 
 
 
389 aa  71.2  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 
446 aa  71.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  18.97 
 
 
396 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2441  glycosyl transferase group 1  30.7 
 
 
351 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.719271  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 
390 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  23.44 
 
 
400 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1019  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.65 
 
 
414 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  22.7 
 
 
364 aa  70.9  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2467  glycosyl transferase group 1  28.53 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2323  glycosyl transferase, group 1  27.32 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  28.26 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 
373 aa  70.1  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.21 
 
 
403 aa  70.1  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6124  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  27.57 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.176978  normal  0.382869 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2410  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
368 aa  69.7  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0321  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
388 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0357  glycosyl transferase, group 1  25.67 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3213  glycosyl transferase group 1  29.65 
 
 
411 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal  0.69629 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  23.1 
 
 
374 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.41 
 
 
769 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3834  phosphatidylinositol alpha-mannosyltransferase  25.57 
 
 
376 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0382059 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4580  glycosyl transferase, group 1  22.87 
 
 
378 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2576  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496816  normal  0.101525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 
415 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1304  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
441 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  22.77 
 
 
427 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  30.8 
 
 
376 aa  68.6  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
381 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  27.31 
 
 
414 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  26.32 
 
 
557 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2899  group 1 glycosyl transferase  24.61 
 
 
390 aa  67.8  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00186189  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  22.96 
 
 
419 aa  67.8  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
426 aa  68.2  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4215  glycosyl transferase, group 1  34.31 
 
 
407 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.728114  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3418  glycosyl transferase group 1  26.28 
 
 
378 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000166377  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  27.13 
 
 
426 aa  67.4  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.55 
 
 
415 aa  67.4  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2958  glycosyl transferase, group 1  31.31 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>