More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0791 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
342 aa  703    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  85.4 
 
 
331 aa  581  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
313 aa  143  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
311 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  34.77 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  31.6 
 
 
299 aa  132  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  34.52 
 
 
306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
298 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  34.04 
 
 
336 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  33.59 
 
 
311 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  32 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  32 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
306 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
310 aa  118  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  31.56 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
308 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
293 aa  117  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
298 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  31.87 
 
 
299 aa  113  6e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
327 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.37 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  27.61 
 
 
290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
324 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  33.05 
 
 
327 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  31.09 
 
 
282 aa  106  6e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
303 aa  106  7e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  30.57 
 
 
318 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 
705 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
340 aa  103  3e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
318 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 
318 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 
300 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.27 
 
 
379 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 
321 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  34.23 
 
 
340 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  29.66 
 
 
337 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.96 
 
 
355 aa  99.4  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
318 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  25 
 
 
324 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  31.96 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  30.67 
 
 
330 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
279 aa  96.7  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
313 aa  96.3  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  29.72 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  29.43 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  27.41 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.65 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  29.75 
 
 
2401 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
305 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  31.34 
 
 
324 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
329 aa  94  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
327 aa  93.6  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  28.46 
 
 
305 aa  93.6  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  26.59 
 
 
652 aa  93.2  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  29.59 
 
 
1340 aa  92.8  8e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
340 aa  92.8  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
387 aa  92.8  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.73 
 
 
284 aa  92  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.32 
 
 
311 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 
272 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.6 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 
1268 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
1162 aa  90.1  4e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
1523 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
333 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
822 aa  89.7  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.17 
 
 
274 aa  89.4  8e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 
328 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
679 aa  88.6  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
328 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
289 aa  88.6  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
722 aa  88.6  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4524  glycosyl transferase family protein  28.83 
 
 
308 aa  89  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.500037  normal  0.110607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  28.71 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  25.47 
 
 
320 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  25.9 
 
 
283 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
378 aa  87.8  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  27.55 
 
 
334 aa  87.4  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
401 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
303 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
318 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  28.71 
 
 
297 aa  87  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
346 aa  86.7  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
274 aa  87  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.95 
 
 
1523 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3142  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
430 aa  86.3  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  27.49 
 
 
297 aa  86.3  8e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6387  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
340 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0741751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>