More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0757 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
358 aa  733    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  37.61 
 
 
376 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  29.6 
 
 
358 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
378 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  23.08 
 
 
346 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
337 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
318 aa  122  9e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
841 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 
329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
1340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  30.72 
 
 
328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
334 aa  113  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  26.97 
 
 
353 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6344  glycosyl transferase family 2  26.35 
 
 
822 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0187449  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  26.95 
 
 
350 aa  110  3e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  27.76 
 
 
294 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  29.43 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  27.99 
 
 
838 aa  110  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
359 aa  109  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.17 
 
 
379 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.58 
 
 
322 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.83 
 
 
341 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
312 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  32.42 
 
 
366 aa  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0054  glycosyl transferase family 2  32.22 
 
 
557 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  27.9 
 
 
339 aa  106  7e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  33.94 
 
 
283 aa  106  8e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 
340 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  31.43 
 
 
2401 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  26.9 
 
 
320 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  27.92 
 
 
836 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
331 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 
313 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
841 aa  103  6e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27 
 
 
322 aa  103  6e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  24.28 
 
 
321 aa  102  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
320 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
313 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  27.78 
 
 
332 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  25.97 
 
 
337 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
311 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2352  glycosyl transferase family 2  26.7 
 
 
337 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013468  hitchhiker  0.0000313698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
300 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  22.29 
 
 
320 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  24.07 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  30.32 
 
 
290 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
291 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 
324 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 
337 aa  96.3  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0256  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
279 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  26.22 
 
 
348 aa  95.9  8e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1415  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 
312 aa  96.3  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435994 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  33.18 
 
 
1162 aa  95.5  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
345 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  24.58 
 
 
298 aa  95.1  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  25.44 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1700  glycosyl transferase family protein  29.02 
 
 
312 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0275555 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 
298 aa  94  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0338  glycosyl transferase family 2  32.31 
 
 
288 aa  93.6  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.378739 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  25.63 
 
 
338 aa  92.8  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  27.84 
 
 
652 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4025  glycosyl transferase family protein  29.62 
 
 
346 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  23.14 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
308 aa  90.5  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  27.45 
 
 
334 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  30.1 
 
 
345 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  30.97 
 
 
1106 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
299 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
308 aa  89  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0620  glycosyl transferase, group 2 family protein  30 
 
 
610 aa  88.2  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  23.9 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  29.25 
 
 
274 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  26.49 
 
 
714 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
286 aa  88.2  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2023  family 2 glycosyl transferase  27.51 
 
 
292 aa  88.6  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  31.6 
 
 
291 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
525 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
311 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.09 
 
 
1523 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4940  glycosyl transferase family protein  29.44 
 
 
336 aa  87.8  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.860283 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4393  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
291 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.023883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
310 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  25.48 
 
 
308 aa  86.3  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  25.35 
 
 
302 aa  86.3  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
1267 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  29.78 
 
 
1435 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 
1739 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2342  glycosyl transferase family protein  29.13 
 
 
270 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
304 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2651  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
303 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
280 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 
342 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>