More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0738 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  861    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  82.26 
 
 
439 aa  652    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  51.89 
 
 
447 aa  379  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  49.52 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  42.76 
 
 
434 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  36.89 
 
 
420 aa  286  7e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  37.44 
 
 
425 aa  261  2e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.54 
 
 
421 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.1 
 
 
417 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
434 aa  250  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.54 
 
 
421 aa  250  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  35.61 
 
 
429 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.89 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  37.68 
 
 
461 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.8 
 
 
430 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  37.8 
 
 
425 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  35.98 
 
 
424 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  32.41 
 
 
414 aa  238  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  36.88 
 
 
426 aa  238  2e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 
442 aa  237  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  37.15 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
422 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  43.85 
 
 
284 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  35.91 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  34.3 
 
 
443 aa  231  1e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  38.44 
 
 
439 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.17 
 
 
443 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  36.12 
 
 
420 aa  230  3e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  34.56 
 
 
456 aa  230  4e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 
429 aa  229  7e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.97 
 
 
448 aa  229  7e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  35.75 
 
 
464 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  36.2 
 
 
435 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 
432 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  36.18 
 
 
464 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  35.06 
 
 
425 aa  226  7e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  36.16 
 
 
426 aa  226  7e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  35.78 
 
 
431 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  36.17 
 
 
432 aa  224  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  34.07 
 
 
436 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  34.07 
 
 
436 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  34.07 
 
 
436 aa  223  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.24 
 
 
442 aa  223  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  30.17 
 
 
424 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.37 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  34.01 
 
 
464 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  35.33 
 
 
464 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.85 
 
 
424 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  36.24 
 
 
447 aa  219  7.999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.72 
 
 
455 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  32.16 
 
 
429 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  35.37 
 
 
452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.6 
 
 
424 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.87 
 
 
454 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.37 
 
 
447 aa  217  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
464 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.72 
 
 
455 aa  216  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  32.79 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  36.43 
 
 
430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 
444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  37.67 
 
 
443 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.11 
 
 
467 aa  212  9e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.23 
 
 
468 aa  212  9e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  35.38 
 
 
437 aa  212  9e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  33.76 
 
 
445 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
470 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  33.76 
 
 
445 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  37.23 
 
 
537 aa  210  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.31 
 
 
434 aa  209  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.82 
 
 
447 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  39.77 
 
 
287 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  33.9 
 
 
440 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.59 
 
 
421 aa  208  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.39 
 
 
287 aa  206  6e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  33.49 
 
 
435 aa  206  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.74 
 
 
431 aa  205  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 
437 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  32.36 
 
 
434 aa  204  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  36.81 
 
 
431 aa  204  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  35.98 
 
 
423 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  32.01 
 
 
431 aa  203  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 
276 aa  203  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  29.88 
 
 
439 aa  203  5e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  34.61 
 
 
490 aa  203  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  33.77 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  36.07 
 
 
457 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  30.27 
 
 
404 aa  200  3e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  32.7 
 
 
442 aa  201  3e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 
483 aa  200  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  38.62 
 
 
296 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 
284 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  36.91 
 
 
484 aa  199  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  34.86 
 
 
439 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  41.96 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  42.35 
 
 
284 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 
448 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.54 
 
 
433 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>