12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0729 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0729  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 191 aa  371  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4387  hypothetical protein  85.42 
 
 		 192 aa  322  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0652  SNARE associated Golgi protein  52.07 
 
 		 186 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.297918  normal  0.0118286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0039  SNARE associated Golgi protein  42.25 
 
 		 152 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.123227  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_48  hypothetical protein  32.14 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00550063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0045  hypothetical protein  32.14 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0015548  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0048  hypothetical protein  30.95 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0254936  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1195  hypothetical protein  25.94 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1221  hypothetical protein  23.85 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1414  hypothetical protein  24.04 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0347  hypothetical protein  31.69 
 
 		 206 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_10211  predicted protein  25.47 
 
 		 292 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00529619 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>