43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0707 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4351  hypothetical protein  75.74 
 
 		 710 aa  1090    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0471949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3155  hypothetical protein  48.42 
 
 		 717 aa  645    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000836331  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0707  hypothetical protein  100 
 
 		 709 aa  1420    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.95657  normal  0.0125392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  51.11 
 
 		 769 aa  244  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  50.7 
 
 		 891 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3121  hypothetical protein  47.96 
 
 		 792 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3007  hypothetical protein  46.13 
 
 		 576 aa  227  6e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0924  WD40 domain protein beta Propeller  46.18 
 
 		 618 aa  226  9e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0358135  normal  0.463223 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3913  hypothetical protein  45.39 
 
 		 289 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3724  hypothetical protein  46.01 
 
 		 289 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.010333 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3752  hypothetical protein  46.77 
 
 		 773 aa  213  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000190776  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  45.42 
 
 		 629 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  43.61 
 
 		 758 aa  200  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  44.91 
 
 		 760 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  36.99 
 
 		 620 aa  186  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1595  polysaccharide deacetylase  36.45 
 
 		 510 aa  180  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0639378  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4231  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 1096 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3594  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.01 
 
 		 1100 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.29124  hitchhiker  0.0000227347 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0123  Tetratricopeptide TPR_4  27.63 
 
 		 1106 aa  95.9  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0938  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1151 aa  91.3  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.277335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3867  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 1116 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.409704  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1119  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.18 
 
 		 1093 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02405  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1093 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.753671  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1128  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1093 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2834  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1124 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2702  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1124 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02441  hypothetical protein  26.18 
 
 		 1093 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3782  tetratricopeptide repeat protein  26.18 
 
 		 1124 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2702  TPR repeat-containing protein  26.18 
 
 		 1093 aa  85.1  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3370  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 		 1146 aa  78.2  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.707224  normal  0.946733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0888  hypothetical protein  31.48 
 
 		 642 aa  75.1  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.0581061 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37170  tetratricopeptide repeat protein  24.94 
 
 		 1126 aa  73.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.285738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1361  hypothetical protein  25.76 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3568  hypothetical protein  26.11 
 
 		 330 aa  62  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.398485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1713  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1072 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1342  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.32152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2519  hypothetical protein  25.42 
 
 		 333 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00503793  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4112  Tetratricopeptide domain protein  23.71 
 
 		 1046 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  37.66 
 
 		 350 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0892  Tetratricopeptide TPR_4  24.35 
 
 		 667 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.224705  normal  0.102157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.9 
 
 		 586 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  30.77 
 
 		 480 aa  45.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  30.59 
 
 		 492 aa  43.9  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>