More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0695 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0490  Peptidase M16C associated domain protein  48.59 
 
 
969 aa  893    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1780  Peptidase M16C associated domain protein  55.61 
 
 
969 aa  1003    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.126781  normal  0.432438 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41654  predicted protein  47.29 
 
 
979 aa  904    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00193617  normal  0.306826 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1565  Peptidase M16C associated domain protein  49.69 
 
 
968 aa  914    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0498145  normal  0.0547201 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2044  peptidase M16C associated domain-containing protein  50.36 
 
 
964 aa  939    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_232  predicted protein  42.11 
 
 
986 aa  760    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0345  Peptidase M16C associated domain protein  46.77 
 
 
970 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0396626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2677  PreP peptidase  51 
 
 
1046 aa  971    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1365  Peptidase M16C associated domain protein  50.63 
 
 
968 aa  895    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0645  peptidase M16C associated domain-containing protein  35.54 
 
 
992 aa  637    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141412  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0695  peptidase M16C associated domain-containing protein  100 
 
 
968 aa  1966    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00570537  decreased coverage  0.000127809 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1656  putative peptidase  36.04 
 
 
973 aa  659    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0884161  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1395  peptidase, putative  36.24 
 
 
973 aa  661    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.131852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0158  peptidase M16C associated domain-containing protein  87.71 
 
 
968 aa  1754    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1661  peptidase M16C associated domain-containing protein  54.51 
 
 
976 aa  1074    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.902377 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0673  metalloprotease  34.85 
 
 
985 aa  543  1e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2871  peptidase M16C associated domain-containing protein  34.12 
 
 
987 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000230302  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1179  peptidase M16C associated  33.27 
 
 
987 aa  501  1e-140  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0156529 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1865  M16 family peptidase  31.55 
 
 
1017 aa  495  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000469623  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1643  peptidase M16C associated  36.62 
 
 
972 aa  486  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  normal  0.901695 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0378  Peptidase M16C associated domain protein  32.47 
 
 
1010 aa  471  1.0000000000000001e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.858415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1217  Peptidase M16C associated domain protein  34.23 
 
 
999 aa  466  9.999999999999999e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00171078  normal  0.0476077 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04570  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.16 
 
 
985 aa  456  1.0000000000000001e-126  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1130  peptidase M16-like  33.05 
 
 
970 aa  451  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.827511  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1478  Peptidase M16C associated domain protein  33.93 
 
 
970 aa  451  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4245  peptidase M16C associated domain-containing protein  31.46 
 
 
973 aa  451  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0157444  hitchhiker  0.0000000002425 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32286  predicted protein  33.72 
 
 
1034 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.414837  normal  0.522406 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20700  predicted Zn-dependent peptidase, insulinase  33.88 
 
 
972 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1857  putative metalloprotease  31.88 
 
 
983 aa  440  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.471387 
 
 
-
 
NC_002620  TC0211  insulinase family metalloprotease  30.93 
 
 
975 aa  429  1e-118  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2936  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.24 
 
 
967 aa  424  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0337172  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1885  peptidase M16C associated domain-containing protein  32.36 
 
 
974 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2076  peptidase M16-like  31.23 
 
 
983 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0197  Peptidase M16C associated domain protein  29.09 
 
 
949 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03853  Mitochondrial presequence protease Precursor (EC 3.4.24.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B6H7]  29.13 
 
 
1049 aa  379  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.901124  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0233  peptidase M16 inactive domain protein  26.74 
 
 
971 aa  377  1e-103  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.312549  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1842  peptidase M16 familiy  29.11 
 
 
1024 aa  349  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.284572  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2129  peptidase M16-like  28.83 
 
 
1025 aa  347  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76282  predicted protein  28.5 
 
 
1046 aa  337  7.999999999999999e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.967871  normal  0.769643 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1843  peptidase M16C associated domain-containing protein  28.56 
 
 
1032 aa  335  2e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000453364  unclonable  0.00000000218752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2447  peptidase M16 domain protein  23.3 
 
 
1137 aa  298  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04540  cytoplasm protein, putative  23.5 
 
 
1054 aa  145  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0121322  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84931  predicted protein  31.6 
 
 
1049 aa  125  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_09434  zinc metalloprotease, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07610)  21.35 
 
 
1057 aa  108  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.169282 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  24.24 
 
 
937 aa  99  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  25.15 
 
 
945 aa  91.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  28.89 
 
 
928 aa  85.1  0.000000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  27.49 
 
 
439 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  24.38 
 
 
919 aa  82  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  22.67 
 
 
896 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  24.77 
 
 
912 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3614  peptidase M16 domain protein  25.94 
 
 
424 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600859 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  25.69 
 
 
949 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1147  peptidase M16 domain-containing protein  24.86 
 
 
431 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  26.02 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  25.59 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6664  peptidase M16 domain protein  25.23 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3613  peptidase M16 domain protein  25.55 
 
 
431 aa  75.1  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.406758 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1070  peptidase M16 domain protein  30.46 
 
 
878 aa  73.2  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3486  peptidase M16-like protein  25.79 
 
 
441 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0315623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1896  peptidase M16 domain protein  23.81 
 
 
434 aa  72.4  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  25.07 
 
 
513 aa  72.4  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1713  putative Zn-dependent protease  25.59 
 
 
461 aa  72  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3444  hypothetical protein  25.57 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  27.1 
 
 
441 aa  71.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  27.1 
 
 
457 aa  70.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0921  peptidase M16 domain protein  24.78 
 
 
427 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0782213  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  26.05 
 
 
464 aa  70.1  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0895  peptidase M16 domain protein  24.78 
 
 
427 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1057  peptidase M16 domain protein  27.19 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1020  peptidase M16 domain protein  24.77 
 
 
429 aa  69.3  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  25.44 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2737  peptidase M16-like  25.15 
 
 
465 aa  68.9  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  24.46 
 
 
457 aa  68.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0936  peptidase M16 domain-containing protein  23.56 
 
 
420 aa  68.2  0.0000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.891405  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  25.7 
 
 
921 aa  68.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1646  peptidase M16 domain-containing protein  27.01 
 
 
868 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.372259  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4537.2  Zn-dependent peptidase  25 
 
 
443 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  26.16 
 
 
442 aa  66.6  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1211  peptidase, M16 family  26.26 
 
 
419 aa  66.6  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.150859  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1237  peptidase M16 domain-containing protein  22.92 
 
 
419 aa  65.9  0.000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  24.29 
 
 
942 aa  66.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  27.73 
 
 
463 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  23.56 
 
 
948 aa  66.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3815  peptidase M16 domain-containing protein  24.71 
 
 
443 aa  65.9  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  27.27 
 
 
476 aa  65.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4342  peptidase M16-like  25.61 
 
 
431 aa  65.5  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472968  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1429  M16 family peptidase  21.99 
 
 
419 aa  65.1  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.400029  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2204  peptidase M16 domain-containing protein  25.78 
 
 
469 aa  65.1  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0863446  normal  0.285951 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  25.37 
 
 
957 aa  64.7  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  24.85 
 
 
489 aa  64.7  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0430  peptidase M16-like  24.26 
 
 
453 aa  64.7  0.000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  23.44 
 
 
934 aa  63.9  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0543  peptidase M16 domain protein  24.56 
 
 
439 aa  64.3  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00961156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  27.17 
 
 
879 aa  63.9  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3742  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 
443 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  22.03 
 
 
912 aa  64.3  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  26.52 
 
 
428 aa  63.9  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3940  peptidase M16 domain-containing protein  25.9 
 
 
443 aa  63.9  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>