More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0623 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  100 
 
 
278 aa  568  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  80.87 
 
 
282 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2147  methyltransferase type 11  42.01 
 
 
283 aa  222  4e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  40.53 
 
 
275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  40.34 
 
 
287 aa  198  7e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  43.91 
 
 
261 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  39.65 
 
 
279 aa  175  7e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  38.69 
 
 
274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  42.86 
 
 
276 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  38.28 
 
 
271 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3249  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 
382 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.82 
 
 
280 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.21 
 
 
283 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  32.69 
 
 
283 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1808  Methyltransferase type 11  30.05 
 
 
286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20470  tocopherol o-methyltransferase  35.44 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.03 
 
 
305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80971  predicted protein  33.15 
 
 
377 aa  112  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30710  predicted protein  34.72 
 
 
365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.499516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3261  SAM-dependent methyltransferase  29.33 
 
 
287 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234445  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1078  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.55 
 
 
330 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3884  methyltransferase type 11  29.33 
 
 
293 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658922  normal  0.0229957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
328 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3463  type 11 methyltransferase  34.59 
 
 
280 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.48 
 
 
282 aa  105  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33530  predicted protein  39.22 
 
 
392 aa  104  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.5 
 
 
306 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40586  predicted protein  29.33 
 
 
342 aa  103  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  32.24 
 
 
343 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2025  sterol-C-methyltransferase  35.26 
 
 
310 aa  102  7e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07146  sterol 24-c-methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03630)  32.77 
 
 
377 aa  101  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.690937  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2173  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
328 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0853287 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0676  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
280 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_10824  predicted protein  35.26 
 
 
304 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0540311  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  32.16 
 
 
304 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0809  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
264 aa  100  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266836  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3215  methyltransferase type 11  32.04 
 
 
278 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000307808 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2451  Methyltransferase type 11  27.82 
 
 
267 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.361549  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0596  delta(24)-sterol C-methyltransferase  32.58 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000138458  normal  0.70463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19461  SAM-binding motif-containing protein  28.64 
 
 
310 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.26 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42420  predicted protein  29.17 
 
 
317 aa  97.1  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.679564 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1071  UbiE/COQ5 family methyltransferase  28.64 
 
 
310 aa  96.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.29583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1559  hypothetical protein  33.18 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00538046  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23681  SAM-binding motif-containing protein  32.63 
 
 
304 aa  94.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0592385 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10269  predicted protein  32.1 
 
 
295 aa  94.7  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16281  SAM-binding motif-containing protein  32.8 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1353  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
280 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0337053  hitchhiker  0.000000492717 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  35.37 
 
 
311 aa  93.2  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4388  methyltransferase type 11  28.84 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0989044  normal  0.24508 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  36.05 
 
 
310 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.77 
 
 
274 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  26.38 
 
 
270 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.69 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  29.61 
 
 
1012 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16851  SAM-binding motif-containing protein  34.69 
 
 
311 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  28.51 
 
 
261 aa  90.5  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3306  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.5 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10074  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.21 
 
 
559 aa  89.7  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0668  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
288 aa  89  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
279 aa  89  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6747  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
286 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2447  methyltransferase type 11  23.46 
 
 
277 aa  88.2  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  34.69 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0050  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.02 
 
 
471 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2109  methyltransferase type 11  26.99 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.709004  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1456  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131831  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1677  methyltransferase type 11  26.61 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.138744  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4893  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.242267 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  36.52 
 
 
276 aa  82.4  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4452  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
277 aa  82  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0984  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
300 aa  81.6  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  29.01 
 
 
776 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1836  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
296 aa  82  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01614  S-adenosyl-methionine-sterol-C-methyltransferas (AFU_orthologue; AFUA_4G09190)  29.89 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.787149  normal  0.132042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.55 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1057  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.783467  hitchhiker  0.00010073 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1026  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
277 aa  79.7  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  30.88 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2797  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.614979 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0725  Methyltransferase type 11  25.36 
 
 
313 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  32.67 
 
 
572 aa  79  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.72 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1411  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
292 aa  78.6  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.456001  normal  0.135358 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  35.29 
 
 
271 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  39.42 
 
 
273 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  39.49 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.34 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0333  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.67 
 
 
445 aa  77  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.953487 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17021  putative sarcosine-dimethylglycine methyltransferase  24.38 
 
 
282 aa  76.3  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  35.71 
 
 
265 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2422  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  29.21 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  39.83 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4594  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.88 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>