38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0622 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  100 
 
 		 326 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  72.35 
 
 		 326 aa  466  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  38.87 
 
 		 324 aa  212  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  36.24 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  35.22 
 
 		 338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  32.91 
 
 		 322 aa  180  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  35.53 
 
 		 329 aa  179  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  33.12 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  30.64 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  29.88 
 
 		 344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  30.6 
 
 		 325 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  29.34 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  29.61 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4149  hypothetical protein  24.83 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.24 
 
 		 769 aa  97.8  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  26.33 
 
 		 745 aa  95.9  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2608  hypothetical protein  30.13 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242922  normal  0.750239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  26.79 
 
 		 755 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  27.67 
 
 		 751 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 750 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  26.4 
 
 		 756 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4335  hypothetical protein  28.32 
 
 		 343 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3107  hypothetical protein  28.26 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000114521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.18 
 
 		 751 aa  76.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3801  hypothetical protein  25.17 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  24 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  27.04 
 
 		 393 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0947  lyase  27.87 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000129184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  26.06 
 
 		 373 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  24.03 
 
 		 448 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3530  hypothetical protein  22.3 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6100  methyltransferase type 12  25.96 
 
 		 364 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6509  hypothetical protein  25.83 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1320  hypothetical protein  25.83 
 
 		 364 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.472657  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1634  terpene synthase family protein  21.77 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1721  terpene synthase family protein  21.77 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.24708  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0219  terpene synthase family protein  21.77 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.315963  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1287  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48182  normal  0.0103132 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>