More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0607 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0607  Cof-like hydrolase  100 
 
 
271 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.0000496024  normal  0.512599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3524  Cof-like hydrolase  81.18 
 
 
271 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.756821  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1119  Cof-like hydrolase  43.61 
 
 
271 aa  189  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.78603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  40.67 
 
 
268 aa  182  7e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0258  hypothetical protein  37.73 
 
 
268 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2032  Cof-like hydrolase  36.67 
 
 
278 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.201826 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0296  Cof-like hydrolase  39.64 
 
 
269 aa  168  8e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3056  Cof-like hydrolase  37.04 
 
 
268 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  36.33 
 
 
272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3945  Cof-like hydrolase  37.41 
 
 
268 aa  159  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.411023 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  35.06 
 
 
273 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4000  Cof-like hydrolase  37.05 
 
 
271 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4042  Cof-like hydrolase  37.05 
 
 
271 aa  152  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  35.96 
 
 
267 aa  149  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  34.64 
 
 
281 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  34.64 
 
 
281 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5125  sugar phosphatase  34.42 
 
 
270 aa  143  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.231854 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0138  Cof-like hydrolase  34.18 
 
 
279 aa  142  5e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0213598  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4165  sugar phosphatase  34.29 
 
 
281 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  0.797935 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03580  predicted hydrolase  34.42 
 
 
270 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0006  Cof-like hydrolase  34.42 
 
 
270 aa  142  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03524  hypothetical protein  34.42 
 
 
270 aa  142  7e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4062  sugar phosphatase  34.42 
 
 
270 aa  142  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4206  sugar phosphatase  34.42 
 
 
270 aa  142  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.24952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3909  sugar phosphatase  34.42 
 
 
270 aa  142  8e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0006  sugar phosphatase  34.42 
 
 
270 aa  142  8e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1752  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
271 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00695054  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  34.29 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4060  sugar phosphatase  34.29 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2123  Cof-like hydrolase  34.1 
 
 
266 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000204309  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0036  sugar phosphatase  33.21 
 
 
271 aa  135  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.148039 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0005  sugar phosphatase  32.36 
 
 
269 aa  133  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2434  Cof protein  35.21 
 
 
282 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3925  sugar phosphatase  31.64 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679086  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  32 
 
 
279 aa  132  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  28.93 
 
 
274 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4149  sugar phosphatase  32 
 
 
269 aa  132  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.680051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0278  Cof-like hydrolase  31.72 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0153774  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.18 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.18 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4173  sugar phosphatase  31.64 
 
 
269 aa  130  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.729204  hitchhiker  0.0085653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0012  sugar phosphatase  31.27 
 
 
271 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.758679  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0005  sugar phosphatase  32.86 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4730  Cof-like hydrolase  34.96 
 
 
270 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3223  Cof-like hydrolase  31.9 
 
 
273 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.887352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0280  Cof-like hydrolase  31.58 
 
 
264 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0013  sugar phosphatase  30.91 
 
 
271 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0223  Cof-like hydrolase  28.27 
 
 
273 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0606328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0579  HAD family hydrolase  28.47 
 
 
279 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.407904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  28.01 
 
 
279 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.3 
 
 
270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1451  Cof-like hydrolase  27.84 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  27.44 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0410  HAD family hydrolase  28.83 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.661813  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  31.89 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  31.64 
 
 
273 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.5 
 
 
273 aa  108  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1953  HAD superfamily hydrolase  30.91 
 
 
270 aa  109  6e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0986  hypothetical protein  31.9 
 
 
273 aa  108  8.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  28.73 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.5 
 
 
273 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1075  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1220  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.45 
 
 
269 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3785  sugar phosphatase  31.25 
 
 
277 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  0.40835 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.25 
 
 
273 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1400  HAD superfamily hydrolase  32.1 
 
 
272 aa  108  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  28.94 
 
 
273 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.72 
 
 
269 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.52 
 
 
265 aa  107  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0883  Cof-like hydrolase  28.3 
 
 
269 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.5 
 
 
273 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4121  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.08 
 
 
269 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  25.95 
 
 
262 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  28.62 
 
 
268 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  31.48 
 
 
268 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1285  HAD superfamily hydrolase  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1325  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1087  HAD superfamily hydrolase  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1069  hydrolase  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  27.68 
 
 
269 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1174  HAD superfamily hydrolase  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.83 
 
 
269 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1285  HAD superfamily hydrolase  27.92 
 
 
286 aa  103  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000203899  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.47 
 
 
269 aa  103  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1064  hydrolase  30.45 
 
 
269 aa  103  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  26.46 
 
 
279 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.15 
 
 
274 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1448  Cof-like hydrolase  29.73 
 
 
285 aa  102  5e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1519  HAD family hydrolase  25.25 
 
 
277 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0488  HAD superfamily hydrolase  26.55 
 
 
268 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00256644  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0550  Cof-like hydrolase  25.71 
 
 
280 aa  102  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  25.35 
 
 
276 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3948  Cof-like hydrolase  30.25 
 
 
274 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  31.5 
 
 
273 aa  101  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2879  phosphotransferase  31.05 
 
 
273 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1881  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 
284 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.130463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>