156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0561 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1201  amino acid permease-associated region  62.62 
 
 		 615 aa  738    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0215506 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3857  amino acid permease-associated region  91.04 
 
 		 614 aa  1083    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000427762  unclonable  0.0000151298 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0561  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 614 aa  1231    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1191  amino acid permease-associated region  51.03 
 
 		 627 aa  612  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000300657  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4342  amino acid permease-associated region  52.27 
 
 		 611 aa  586  1e-166  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676732  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0032  hypothetical protein  47.81 
 
 		 693 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2069  hypothetical protein  49.76 
 
 		 672 aa  535  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000284344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  46.2 
 
 		 781 aa  534  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4627  amino acid permease  44.5 
 
 		 608 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.486141  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1324  hypothetical protein  46.79 
 
 		 668 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.112475  normal  0.347698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1068  hypothetical protein  47.58 
 
 		 611 aa  514  1e-144  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1112  hypothetical protein  46.84 
 
 		 612 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0727554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1880  hypothetical protein  45.06 
 
 		 608 aa  502  1e-141  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3464  hypothetical protein  44.89 
 
 		 608 aa  501  1e-140  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000852812  decreased coverage  4.4181400000000004e-23 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1642  putative transporter  44.25 
 
 		 654 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05725  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5190  hypothetical protein  44.59 
 
 		 731 aa  497  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.01905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1635  putative transporter  44.34 
 
 		 658 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000053335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1714  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  44.5 
 
 		 683 aa  491  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.553207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1522  hypothetical protein  46.15 
 
 		 674 aa  490  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.579036  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1878  amino acid transporter  44.6 
 
 		 677 aa  491  1e-137  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.148156  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3755  amino acid transporter  45.6 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000328435  normal  0.279832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4526  amino acid transporter  44.29 
 
 		 655 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0966094  normal  0.421958 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1921  hypothetical protein  45.06 
 
 		 608 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.0058200000000004e-24 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2198  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 664 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2244  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 664 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2187  amino acid permease-associated region  44.51 
 
 		 664 aa  482  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798252 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1113  hypothetical protein  43.09 
 
 		 608 aa  483  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1210  amino acid permease  44.6 
 
 		 585 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.177071  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1397  hypothetical protein  44.71 
 
 		 674 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1487  hypothetical protein  45.41 
 
 		 696 aa  481  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479036  normal  0.671369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1697  amino acid permease  44.89 
 
 		 608 aa  478  1e-133  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000377076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1740  amino acid permease  44.89 
 
 		 608 aa  476  1e-133  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000902487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1994  hypothetical protein  44.89 
 
 		 608 aa  476  1e-133  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000355688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1966  hypothetical protein  44.73 
 
 		 608 aa  474  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000121839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2258  amino acid transporter  43.31 
 
 		 672 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.186562  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1452  hypothetical protein  45.89 
 
 		 691 aa  473  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000394394  normal  0.0118097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1709  hypothetical protein  44.55 
 
 		 667 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.71467  normal  0.0434218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2284  hypothetical protein  43.53 
 
 		 681 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.225884 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2018  hypothetical protein  41.36 
 
 		 609 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0010431  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2474  amino acid permease-associated region  42.88 
 
 		 664 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0436881  normal  0.698819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6758  hypothetical protein  44.41 
 
 		 704 aa  463  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0797924 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2243  amino acid transporter-like protein  40.61 
 
 		 629 aa  463  1e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2466  hypothetical protein  40.26 
 
 		 609 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000341492  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12705  alanine, valine and leucine rich integral membrane protein  44.34 
 
 		 657 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2515  hypothetical protein  40.26 
 
 		 609 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000264968  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1974  amino acid transporter-like protein  40.65 
 
 		 629 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2902  putative transporter  41.31 
 
 		 685 aa  457  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3408  amino acid permease-associated region  43.76 
 
 		 750 aa  453  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.492526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16180  hypothetical protein  42.92 
 
 		 672 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3926  amino acid permease-associated region  43.28 
 
 		 664 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.036267  normal  0.618812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1190  amino acid permease-associated region  44.08 
 
 		 653 aa  449  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000537417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1601  amino acid transporter  42.1 
 
 		 636 aa  451  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.654948  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1943  putative transporter  43.61 
 
 		 678 aa  444  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630635  normal  0.0235121 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0699  amino acid transporter-like protein  39.75 
 
 		 627 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000494308  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1503  amino acid transporter  40.93 
 
 		 614 aa  437  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0415343  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1404  amino acid permease  41.9 
 
 		 678 aa  437  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.943899 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1916  hypothetical protein  42.5 
 
 		 667 aa  424  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.635201  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21241  amino acid transporter  42.79 
 
 		 615 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97289 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1563  putative transporter  42.3 
 
 		 677 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.117047  normal  0.694586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1638  amino acid transporter  39.17 
 
 		 615 aa  408  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0002  hypothetical protein  41.95 
 
 		 622 aa  409  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000285538  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0357  amino acid permease-associated region  39.52 
 
 		 612 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000770343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1791  amino acid transporter  41.16 
 
 		 614 aa  392  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243869  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1922  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  41.42 
 
 		 777 aa  367  1e-100  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4183  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  38.74 
 
 		 647 aa  362  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.75 
 
 		 774 aa  359  9e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1503  putative aminoacid/polyamine transporter, permease protein  38.26 
 
 		 619 aa  329  8e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  35.79 
 
 		 815 aa  329  9e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1747  hypothetical protein  47.77 
 
 		 365 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1443  amino acid permease-associated region  43.51 
 
 		 470 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.839992  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13060  amino acid transporter  30.88 
 
 		 650 aa  210  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1726  amino acid permease, C-terminal  42.07 
 
 		 272 aa  191  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0922786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2571  amino acid transporter-like  28.7 
 
 		 656 aa  180  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715012 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3101  amino acid transporter-like protein  31.76 
 
 		 685 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2826  hypothetical protein  29.89 
 
 		 713 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2448  amino acid permease-associated region  29.89 
 
 		 713 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0321394 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1593  amino acid transporter-like protein  29.55 
 
 		 657 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1725  amino acid permease, central region  44.95 
 
 		 253 aa  170  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.759722  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0945  amino acid transporter-like protein  30.96 
 
 		 680 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0942  amino acid transporter-like protein  31.1 
 
 		 680 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.589203  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3262  amino acid permease-associated region  29.48 
 
 		 657 aa  160  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0024  lysine-specific permease  30.11 
 
 		 647 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1995  hypothetical protein  30.11 
 
 		 647 aa  148  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1748  hypothetical protein  37.16 
 
 		 218 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0151353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1041  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 657 aa  121  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1038  amino acid permease-associated region  29.9 
 
 		 657 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0979  amino acid permease-associated region  31.13 
 
 		 655 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.696975  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1724  amino acid permease, N-terminal  45 
 
 		 101 aa  87  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4081  amino acid permease  24.83 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1196  amino acid permease-associated region  21.08 
 
 		 455 aa  58.9  0.0000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1760  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4556  amino acid permease-associated region  24.56 
 
 		 441 aa  57  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2033  amino acid permease-associated region  24.49 
 
 		 459 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0060  amino acid permease-associated region  22.52 
 
 		 440 aa  55.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0530  amino acid permease-associated region  23 
 
 		 443 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0535  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 443 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0492  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 443 aa  53.9  0.000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3458  amino acid permease-associated region  23.81 
 
 		 443 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1782  ethanolamine transporter  25.73 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0168265  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3809  amino acid permease-associated region  22.65 
 
 		 443 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>