More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0560 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  39.51 
 
 		 1023 aa  642    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  42.49 
 
 		 974 aa  671    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.78 
 
 		 990 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.67 
 
 		 976 aa  697    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  88.34 
 
 		 978 aa  1773    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.39 
 
 		 1032 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.86 
 
 		 995 aa  703    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.12 
 
 		 1025 aa  710    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.23 
 
 		 971 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  41.93 
 
 		 1011 aa  705    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  39.94 
 
 		 1032 aa  678    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.48 
 
 		 1007 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  40.88 
 
 		 967 aa  657    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  42.37 
 
 		 973 aa  712    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  38.7 
 
 		 1055 aa  659    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  42.32 
 
 		 1038 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  41.19 
 
 		 984 aa  699    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.95 
 
 		 989 aa  680    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  37.28 
 
 		 968 aa  645    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.66 
 
 		 962 aa  793    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.04 
 
 		 961 aa  674    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 		 1070 aa  671    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.81 
 
 		 1046 aa  667    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.28 
 
 		 983 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  39.96 
 
 		 967 aa  712    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  41.87 
 
 		 1007 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  39.92 
 
 		 1024 aa  687    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  38.8 
 
 		 1013 aa  638    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  45.47 
 
 		 952 aa  740    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  39.51 
 
 		 1024 aa  659    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  40.22 
 
 		 975 aa  730    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.77 
 
 		 991 aa  725    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.86 
 
 		 1035 aa  695    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.47 
 
 		 983 aa  680    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.63 
 
 		 1023 aa  670    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.7 
 
 		 1009 aa  671    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  41.64 
 
 		 1014 aa  687    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  38.55 
 
 		 999 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  41.34 
 
 		 996 aa  717    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.68 
 
 		 990 aa  679    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.15 
 
 		 977 aa  701    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  100 
 
 		 976 aa  1995    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.26 
 
 		 1015 aa  697    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.68 
 
 		 990 aa  674    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  46.07 
 
 		 973 aa  836    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  41.14 
 
 		 1005 aa  712    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  39.48 
 
 		 1034 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.65 
 
 		 1025 aa  701    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  38.8 
 
 		 984 aa  632  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  39.19 
 
 		 1015 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  40.06 
 
 		 1031 aa  622  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  37.77 
 
 		 999 aa  621  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  41.26 
 
 		 1050 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.2 
 
 		 1022 aa  612  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  40.79 
 
 		 1050 aa  607  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  40.02 
 
 		 1052 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  36.25 
 
 		 976 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.57 
 
 		 1037 aa  600  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  35.83 
 
 		 930 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  36.63 
 
 		 966 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  38.61 
 
 		 1043 aa  572  1e-161  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  36.93 
 
 		 987 aa  543  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  35.77 
 
 		 945 aa  542  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4174  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.64 
 
 		 1000 aa  530  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.57181  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.04 
 
 		 989 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.66 
 
 		 950 aa  522  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  36.07 
 
 		 975 aa  505  1e-141  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.94 
 
 		 973 aa  501  1e-140  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1470  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.4 
 
 		 997 aa  501  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.271002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0962  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.21 
 
 		 1006 aa  496  1e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.108577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  34.26 
 
 		 1010 aa  491  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  33.79 
 
 		 1021 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32250  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  33.74 
 
 		 974 aa  489  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4803  FAD linked oxidase domain protein  34.86 
 
 		 976 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 		 1002 aa  480  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  31.98 
 
 		 1013 aa  479  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  31.11 
 
 		 1006 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5785  FAD linked oxidase-like  32.4 
 
 		 1018 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6150  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.4 
 
 		 1018 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0601  FAD linked oxidase domain protein  34.67 
 
 		 997 aa  472  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0431766  normal  0.0923771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3016  FAD linked oxidase domain protein  33.56 
 
 		 1010 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.17034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2008  FAD linked oxidase-like protein  30.87 
 
 		 1016 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.180059  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2296  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.01 
 
 		 1023 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2165  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.56 
 
 		 944 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 		 1026 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.2 
 
 		 1018 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  32.1 
 
 		 1018 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1978  FAD linked oxidase  32.66 
 
 		 1018 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000994047 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  32.1 
 
 		 1018 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1018 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1496  FAD linked oxidase  32.56 
 
 		 1018 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.237885  hitchhiker  0.00132557 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 		 1018 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  32.66 
 
 		 1018 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6630  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.3 
 
 		 1018 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  32.05 
 
 		 1018 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  32.1 
 
 		 1018 aa  469  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  32.01 
 
 		 1018 aa  464  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.94 
 
 		 1027 aa  466  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  32.1 
 
 		 1018 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1807  FAD linked oxidase  32.56 
 
 		 1018 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.354547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>