More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0464 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
394 aa  803    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  36.18 
 
 
382 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  35.64 
 
 
393 aa  218  2e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  35.34 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  38.58 
 
 
383 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
397 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  37.73 
 
 
370 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  37.53 
 
 
385 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  35.73 
 
 
375 aa  197  3e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  32.31 
 
 
390 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  35.56 
 
 
395 aa  193  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  33.84 
 
 
378 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 
370 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 
390 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  30.53 
 
 
395 aa  187  3e-46  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  31.41 
 
 
374 aa  186  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
390 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  34.56 
 
 
371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 
380 aa  176  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  29.23 
 
 
374 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  29.37 
 
 
386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 
386 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  34.63 
 
 
373 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 
371 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  30.37 
 
 
366 aa  168  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  38.51 
 
 
431 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  33.1 
 
 
417 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  29.26 
 
 
380 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  31.23 
 
 
376 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
387 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  38.41 
 
 
1261 aa  164  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 
535 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  37.96 
 
 
366 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  28.65 
 
 
381 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  28.12 
 
 
381 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 
381 aa  158  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  27.92 
 
 
375 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  35.27 
 
 
380 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
378 aa  157  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  33.57 
 
 
420 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 
377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  35.27 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
372 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
434 aa  155  9e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
382 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 
378 aa  155  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  36.39 
 
 
381 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  28.39 
 
 
375 aa  155  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  33.17 
 
 
1241 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 
435 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  35.51 
 
 
1089 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 
384 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  34.15 
 
 
398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.5 
 
 
400 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  30.36 
 
 
375 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  36.5 
 
 
1398 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  30.77 
 
 
1241 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  29.4 
 
 
372 aa  151  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
394 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 
376 aa  150  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  29.92 
 
 
372 aa  150  5e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  31.05 
 
 
384 aa  149  9e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 
361 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  29.97 
 
 
408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  40.25 
 
 
394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 
384 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
381 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 
360 aa  147  3e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
370 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.46 
 
 
376 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  29.16 
 
 
375 aa  145  9e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2265  second mannosyl transferase  30.26 
 
 
336 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000285845 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.8 
 
 
361 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0042  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
366 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6016  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 
380 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.435427 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.05 
 
 
351 aa  144  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  29.5 
 
 
384 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  29.35 
 
 
374 aa  144  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 
524 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  28.68 
 
 
393 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  34.31 
 
 
398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  34.71 
 
 
353 aa  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 
374 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1373  Glycosyltransferase-like protein  30.67 
 
 
373 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 
1028 aa  140  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  31.91 
 
 
346 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  31.91 
 
 
346 aa  140  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  36.05 
 
 
1915 aa  139  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
372 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  36.05 
 
 
609 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0048  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
361 aa  138  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  29.03 
 
 
355 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  38.93 
 
 
394 aa  138  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  32.76 
 
 
380 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2894  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
414 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2191  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
414 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0662  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
414 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2516  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.93 
 
 
401 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.508098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>