More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0463 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
293 aa  603  1e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  56.25 
 
 
313 aa  330  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0375  glycosyl transferase family protein  41.58 
 
 
311 aa  206  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  37.93 
 
 
324 aa  193  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  43.11 
 
 
312 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  42.19 
 
 
306 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 
310 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
311 aa  185  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  35.25 
 
 
652 aa  179  7e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 
324 aa  177  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0220  glycosyl transferase family 2  35.86 
 
 
705 aa  173  3e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  38.35 
 
 
336 aa  172  4e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  40.45 
 
 
298 aa  172  7e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3135  glycosyl transferase, putative  36.72 
 
 
318 aa  171  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.331017  normal  0.385632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  36.64 
 
 
317 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2579  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
318 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2720  glycosyl transferase family protein  36.33 
 
 
318 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.372811  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2910  glycosyl transferase family protein  35.55 
 
 
318 aa  164  2e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4605  glycosyl transferase family protein  37.16 
 
 
318 aa  162  4e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.151832  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  36.26 
 
 
299 aa  162  5e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  35.63 
 
 
324 aa  162  6e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2949  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
299 aa  162  8e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0377  glycosyl transferase family protein  38.52 
 
 
314 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.359383  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0264  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.15 
 
 
355 aa  159  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  35.58 
 
 
325 aa  158  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  5.58134e-07  hitchhiker  4.72149e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1795  glycosyl transferase family protein  36.4 
 
 
306 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1949  glycosyl transferase family protein  35.93 
 
 
308 aa  156  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.535237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  35.82 
 
 
327 aa  155  5e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
294 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  36.15 
 
 
334 aa  149  4e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1435  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
324 aa  148  9e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1388  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
324 aa  147  2e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3771  glycosyl transferase family 2  36.5 
 
 
327 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.322166  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3719  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 
327 aa  147  2e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  35.32 
 
 
334 aa  146  4e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 
308 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  34.8 
 
 
333 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  32.38 
 
 
312 aa  142  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3032  glycosyl transferase family protein  34.35 
 
 
714 aa  142  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1298  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 
289 aa  141  1e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
360 aa  141  1e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0094  glycosyl transferase family 2  34.52 
 
 
312 aa  139  4e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.28 
 
 
379 aa  140  4e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
310 aa  139  8e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.24 
 
 
315 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  34.24 
 
 
315 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 
340 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 
290 aa  136  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
272 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  3.44524e-05  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2875  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
324 aa  135  1e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2967  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
324 aa  134  1e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  33.46 
 
 
311 aa  132  6e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
334 aa  129  8e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 
361 aa  129  8e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0842  hypothetical protein  25.71 
 
 
297 aa  128  9e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0858  b-glycosyltransferase  31.32 
 
 
301 aa  127  2e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.043059  normal  0.0575748 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  27.85 
 
 
305 aa  125  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
624 aa  125  8e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2031  family 2 glycosyl transferase  32.51 
 
 
274 aa  125  8e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0817  hypothetical protein  25 
 
 
297 aa  125  9e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  34.63 
 
 
679 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  32.96 
 
 
314 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
317 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0256  glycosyl transferase family 2  32.01 
 
 
334 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0188043  normal  0.110004 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  38.36 
 
 
305 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 
340 aa  124  2e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 
306 aa  123  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
310 aa  122  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  33.22 
 
 
313 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  31.65 
 
 
329 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
298 aa  120  2e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
330 aa  121  2e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
307 aa  120  2e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5097  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 
340 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.912612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4473  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 
340 aa  120  4e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.966057  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  35.2 
 
 
318 aa  119  4e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  31.07 
 
 
337 aa  119  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
298 aa  119  5e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
387 aa  119  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  35.56 
 
 
860 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  35.59 
 
 
303 aa  119  8e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  34.14 
 
 
284 aa  119  8e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  29.8 
 
 
841 aa  118  1e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  31.72 
 
 
318 aa  118  1e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 
314 aa  118  1e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4256  glycosyl transferase family protein  28.52 
 
 
336 aa  117  2e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.586342  normal  0.139884 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 
319 aa  117  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4437  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 
331 aa  117  2e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.749326 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0791  glycosyl transferase family protein  30.4 
 
 
342 aa  117  2e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.965247 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2030  glycosyl transferase family 2  29.66 
 
 
303 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.952561  hitchhiker  0.000668775 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
401 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  33.2 
 
 
282 aa  116  4e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
319 aa  115  8e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1773  glycosyl transferase family protein  31.03 
 
 
303 aa  115  1e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.314835  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0840  hypothetical protein  25.91 
 
 
296 aa  115  1e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  26.21 
 
 
310 aa  114  2e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  36.04 
 
 
300 aa  114  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0238  glycosyltransferase  28.24 
 
 
342 aa  114  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00200202  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
1739 aa  113  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
304 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.965976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>