More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0461 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  84.62 
 
 		 390 aa  676    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 390 aa  789    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  56.51 
 
 		 390 aa  429  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  33.59 
 
 		 394 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.02 
 
 		 375 aa  152  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 380 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  30.46 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.4 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  25.63 
 
 		 374 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0228  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 1089 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 374 aa  130  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  31 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  26.65 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  28.1 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  27.72 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  29.83 
 
 		 434 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0377  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 378 aa  123  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0289897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1068  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 		 371 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.378739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  28.17 
 
 		 435 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  33.87 
 
 		 380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  31.46 
 
 		 370 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 387 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  30.41 
 
 		 383 aa  120  6e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.03 
 
 		 1241 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 		 384 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.69 
 
 		 428 aa  116  5e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  27.78 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 609 aa  116  6e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  30.31 
 
 		 1915 aa  116  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  32.08 
 
 		 859 aa  116  7.999999999999999e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 		 860 aa  115  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 		 380 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.2 
 
 		 377 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  25.17 
 
 		 360 aa  114  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 369 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 370 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  27.95 
 
 		 393 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  27.96 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  27.16 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  24.36 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  24.44 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  24.29 
 
 		 375 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 381 aa  113  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  28.69 
 
 		 351 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 381 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  27.67 
 
 		 850 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  30.31 
 
 		 373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0528  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 		 370 aa  110  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 420 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  26.58 
 
 		 372 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.72 
 
 		 374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  26.45 
 
 		 372 aa  110  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  25.19 
 
 		 378 aa  110  5e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  30.65 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  26.12 
 
 		 373 aa  109  6e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  29.53 
 
 		 381 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  33.98 
 
 		 369 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  34.06 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  31.35 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  29.28 
 
 		 381 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  29.58 
 
 		 1241 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  29.35 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.01 
 
 		 382 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.6 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  32.55 
 
 		 408 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  27.44 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  30.84 
 
 		 1398 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2903  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 358 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1800  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 394 aa  106  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4665  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 367 aa  106  8e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3826  glycosyl transferase, group 1  28.64 
 
 		 379 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.107341  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  23.5 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.5 
 
 		 395 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  25.71 
 
 		 372 aa  105  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  28.16 
 
 		 357 aa  104  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  29.71 
 
 		 1219 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  30.72 
 
 		 1028 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1631  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 846 aa  103  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.343672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  26.12 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 1261 aa  103  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1702  mannosyltransferase  31.28 
 
 		 846 aa  103  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.529704  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2168  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.62 
 
 		 815 aa  102  8e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 431 aa  103  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  28.03 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2593  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2513  glycosyl transferase, group 1  23.88 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>