190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0436 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0436  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  414  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0970705  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4205  hypothetical protein  84.31 
 
 
204 aa  357  5e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.398339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2481  hypothetical protein  63.9 
 
 
205 aa  253  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.646403  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2595  hypothetical protein  60.1 
 
 
205 aa  244  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.267363 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0685  hypothetical protein  60 
 
 
205 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.142193  normal  0.0121521 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1865  hypothetical protein  62.5 
 
 
205 aa  242  3e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.978149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0684  hypothetical protein  60.49 
 
 
205 aa  240  9e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.08866  hitchhiker  0.00090668 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0217  hypothetical protein  59.61 
 
 
233 aa  237  8e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  normal  0.202334 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2404  hypothetical protein  60.32 
 
 
205 aa  236  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.586663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  42.33 
 
 
203 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4461  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0118803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0981  hypothetical protein  37.22 
 
 
197 aa  99  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3074  hypothetical protein  51.49 
 
 
188 aa  95.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3790  hypothetical protein  35.56 
 
 
197 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.880809  normal  0.480481 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3513  protein of unknown function DUF820  30.57 
 
 
218 aa  92.8  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3789  hypothetical protein  35 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.800501  normal  0.668448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0813  hypothetical protein  35.71 
 
 
201 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  29.94 
 
 
187 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0980  hypothetical protein  35 
 
 
200 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1489  protein of unknown function DUF820  27.32 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  28.8 
 
 
183 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  25.71 
 
 
245 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  27.12 
 
 
187 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2061  hypothetical protein  30.6 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1166  hypothetical protein  30.05 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000632173  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  28.65 
 
 
241 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3647  protein of unknown function DUF820  31.21 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0651314 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  33.14 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0024  protein of unknown function DUF820  26.98 
 
 
193 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.164318  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1800  hypothetical protein  27.08 
 
 
191 aa  74.7  0.0000000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.736972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  28.98 
 
 
184 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
191 aa  73.9  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  32.8 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0650  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000163106  unclonable  0.000000000137407 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4673  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.617273 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  29.61 
 
 
257 aa  72  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  26.78 
 
 
190 aa  72  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  24.43 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1528  hypothetical protein  28.99 
 
 
192 aa  71.2  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.379264  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2784  hypothetical protein  35 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  27.95 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0276  protein of unknown function DUF820  32.46 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1631  protein of unknown function DUF820  35.06 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1385  protein of unknown function DUF820  29.28 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1419  protein of unknown function DUF820  28.73 
 
 
188 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  31.87 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  25.57 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2546  hypothetical protein  28.65 
 
 
188 aa  67.8  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4750  protein of unknown function DUF820  31.38 
 
 
187 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.256418  hitchhiker  0.000000893331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0214  protein of unknown function DUF820  24.06 
 
 
184 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1335  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3352  hypothetical protein  34.42 
 
 
210 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0400145  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0998  hypothetical protein  27.45 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.631502  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  27.93 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3553  hypothetical protein  30.43 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0120  protein of unknown function DUF820  32.61 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00291602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  31.88 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0123  protein of unknown function DUF820  27.42 
 
 
185 aa  65.1  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.532678  normal  0.129383 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4148  protein of unknown function DUF820  27.75 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.297117  hitchhiker  0.00000114136 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0863  protein of unknown function DUF820  30.51 
 
 
188 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00000768463  decreased coverage  0.000000790424 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1323  protein of unknown function DUF820  27.62 
 
 
199 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0750  hypothetical protein  25 
 
 
202 aa  63.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00007573  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  24.72 
 
 
242 aa  62.8  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1718  protein of unknown function DUF820  25.54 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  30.29 
 
 
207 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  26.2 
 
 
189 aa  62.4  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1028  protein of unknown function DUF820  28.05 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  22.73 
 
 
181 aa  62  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  29.2 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1002  protein of unknown function DUF820  28.21 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.62603e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  30.87 
 
 
253 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2157  protein of unknown function DUF820  36.36 
 
 
185 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4336  hypothetical protein  30.2 
 
 
227 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145774  hitchhiker  0.00399105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3554  hypothetical protein  31.88 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1335  hypothetical protein  32.61 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4198  protein of unknown function DUF820  27.71 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  31.45 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3383  hypothetical protein  28.28 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0036  protein of unknown function DUF820  24.02 
 
 
191 aa  58.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3766  protein of unknown function DUF820  29.12 
 
 
197 aa  58.2  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1503  hypothetical protein  39.51 
 
 
193 aa  57.4  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000135867  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  27.17 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0819  protein of unknown function DUF820  29.44 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0957178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2128  hypothetical protein  34.65 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578066  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4202  hypothetical protein  29.56 
 
 
198 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.313101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  24.32 
 
 
244 aa  56.2  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0134  hypothetical protein  29.61 
 
 
206 aa  56.6  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243069  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0988  protein of unknown function DUF820  33.82 
 
 
191 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216094 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  31.79 
 
 
185 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4246  protein of unknown function DUF820  32.16 
 
 
194 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0820  protein of unknown function DUF820  40 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0980811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0726  hypothetical protein  27.05 
 
 
208 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.225388  normal  0.518771 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2126  hypothetical protein  28.1 
 
 
227 aa  55.1  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6498  hypothetical protein  35.43 
 
 
184 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.188707  normal  0.480601 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2089  protein of unknown function DUF820  28.39 
 
 
198 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2598  protein of unknown function DUF820  25.86 
 
 
193 aa  54.7  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000930706  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2271  hypothetical protein  25 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0414  protein of unknown function DUF820  32.52 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.993414  normal  0.677151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2158  protein of unknown function DUF820  34.51 
 
 
186 aa  52.8  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3573  protein of unknown function DUF820  28.66 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>