125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0435 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 347 aa  709    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  80 
 
 		 346 aa  568  1e-161  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  39.94 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  39.06 
 
 		 347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  38.21 
 
 		 362 aa  212  5.999999999999999e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  39.81 
 
 		 344 aa  210  3e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  40.18 
 
 		 344 aa  205  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  28.62 
 
 		 359 aa  106  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  26.71 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 		 330 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  26.9 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 		 323 aa  94.4  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  26.61 
 
 		 327 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  25.07 
 
 		 328 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 346 aa  89.7  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  30.64 
 
 		 383 aa  89.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  28.49 
 
 		 314 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.24 
 
 		 843 aa  86.7  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 328 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.74 
 
 		 361 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  26.82 
 
 		 329 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  26.39 
 
 		 329 aa  79.3  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  27.95 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  24.47 
 
 		 328 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  24.78 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.78 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  23.87 
 
 		 328 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.43 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  28.69 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0625  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  24.24 
 
 		 413 aa  69.7  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0132  hypothetical protein  26.83 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.751971  normal  0.181819 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 367 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  27.85 
 
 		 332 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.92 
 
 		 368 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 367 aa  67.4  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  26.44 
 
 		 324 aa  67  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  25.44 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0999  hypothetical protein  28.57 
 
 		 320 aa  61.6  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.277798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  24.78 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  26.86 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  27.25 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  32.59 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  32.59 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0536  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.84854  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0540  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  31.85 
 
 		 482 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  31.08 
 
 		 342 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  35.96 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  35.96 
 
 		 502 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  28.79 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  24.58 
 
 		 381 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3031  FAD dependent oxidoreductase  29.19 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  46.55 
 
 		 428 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  43.1 
 
 		 425 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  32.38 
 
 		 472 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  38.81 
 
 		 469 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  33.33 
 
 		 371 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  23.93 
 
 		 333 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 407 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 424 aa  48.9  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  31.31 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  38.67 
 
 		 494 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  48.15 
 
 		 445 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  38.16 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  41.67 
 
 		 507 aa  47.8  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  33.8 
 
 		 447 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  43.94 
 
 		 438 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  37.62 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  44.44 
 
 		 431 aa  47.8  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  34.74 
 
 		 410 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  36 
 
 		 460 aa  47.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  35.62 
 
 		 488 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  48.08 
 
 		 519 aa  47  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  46.3 
 
 		 437 aa  46.6  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  30.11 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  40.74 
 
 		 505 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  31.08 
 
 		 437 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  43.64 
 
 		 418 aa  45.4  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  42.86 
 
 		 537 aa  45.4  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  43.4 
 
 		 488 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  39.19 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  40.74 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1383  hypothetical protein  38.71 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.152417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  44.44 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  41.82 
 
 		 448 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 473 aa  45.1  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  35.94 
 
 		 490 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  34.18 
 
 		 522 aa  45.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  36.84 
 
 		 446 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  25.33 
 
 		 488 aa  44.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  27.56 
 
 		 512 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>