More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0421 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  491  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  96.33 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4036  two component transcriptional regulator  69.8 
 
 		 248 aa  368  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2168  two component transcriptional regulator, winged helix family  68.57 
 
 		 247 aa  348  5e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.222815 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 229 aa  215  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  48.03 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  47.79 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 224 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  45.78 
 
 		 229 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  45.33 
 
 		 229 aa  205  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 235 aa  205  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  45.74 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 261 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  47.77 
 
 		 235 aa  204  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  45.95 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  47.77 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.35 
 
 		 226 aa  202  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2496  response regulator receiver  47.3 
 
 		 225 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491467  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 231 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 239 aa  202  4e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  46.32 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 229 aa  202  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 237 aa  202  6e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09340  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.67 
 
 		 223 aa  201  7e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.763127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 226 aa  201  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  47.39 
 
 		 235 aa  201  9e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.95 
 
 		 230 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.09 
 
 		 226 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  46.9 
 
 		 229 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  46.7 
 
 		 226 aa  200  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.132847 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.61 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4043  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.02 
 
 		 225 aa  199  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.728877  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.64 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.69 
 
 		 230 aa  198  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  46.32 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2866  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 231 aa  198  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.98 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.74 
 
 		 226 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.3 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.86 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  45.29 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  48.2 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.42 
 
 		 235 aa  196  3e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  46.88 
 
 		 228 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.67 
 
 		 229 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 232 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  44.84 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 230 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  43.81 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4483  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 226 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.759432  decreased coverage  0.000734691 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  43.61 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  44.35 
 
 		 239 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.35 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.3 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 226 aa  192  3e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.85 
 
 		 247 aa  192  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0235  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 230 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0654  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  44 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1832  two component transcriptional regulator  44.69 
 
 		 245 aa  192  6e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.366424  normal  0.561636 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.04 
 
 		 245 aa  191  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0834  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 226 aa  191  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.6033  unclonable  0.00000000040546 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1777  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.26 
 
 		 226 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0722021  normal  0.591414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 230 aa  191  9e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.85 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.11 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 233 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  43.04 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.74 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4929  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0580  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.89 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10499  two component system sensor transduction protein regX3  42.79 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  2.46064e-66  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>