More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0414 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0414  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 511 aa  1047    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3198  AMP-dependent synthetase and ligase  61.78 
 
 		 509 aa  638    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.179395  normal  0.194105 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4612  AMP-dependent synthetase and ligase  89.82 
 
 		 511 aa  948    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0516  putative AMP-dependent synthetase and ligase  40.46 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0286  putative AMP-dependent synthetase and ligase  40.71 
 
 		 530 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1913  AMP-dependent synthetase and ligase  37.57 
 
 		 515 aa  323  6e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0209  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0115  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 		 526 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0098  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 		 522 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.690806  normal  0.913632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4081  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 512 aa  318  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4908  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 512 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.96823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1350  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 507 aa  306  7e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.191133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 		 517 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 		 512 aa  295  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4229  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 512 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 521 aa  292  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0220  AMP-dependent synthetase and ligase  37.6 
 
 		 510 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 511 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 515 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  34.54 
 
 		 565 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.13 
 
 		 520 aa  287  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.92 
 
 		 525 aa  287  4e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 520 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 515 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 		 528 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1405  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0868  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 		 534 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 525 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 516 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1724  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 515 aa  278  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0701995  normal  0.167784 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 510 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 512 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635327 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 516 aa  269  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0861  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 514 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 509 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.33 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 534 aa  266  8e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.55948  normal  0.800046 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.3 
 
 		 524 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 532 aa  262  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0778531  normal  0.0346233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3708  AMP-dependent synthetase and ligase  34.97 
 
 		 551 aa  262  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 534 aa  262  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.24 
 
 		 519 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  32.21 
 
 		 517 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.27 
 
 		 527 aa  261  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 511 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 525 aa  260  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 519 aa  259  6e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 518 aa  259  8e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 517 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.91 
 
 		 518 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 518 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 509 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2026  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 		 517 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.342397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.1 
 
 		 518 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 539 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 524 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.08 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4674  acyl-CoA synthetase  32.62 
 
 		 531 aa  256  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 532 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  32.23 
 
 		 545 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 499 aa  254  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 518 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.52 
 
 		 518 aa  253  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4949  acyl-CoA synthetase  32.5 
 
 		 521 aa  253  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 502 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.439129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 518 aa  252  9.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 		 525 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.25 
 
 		 501 aa  251  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 536 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000011697 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3747  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 514 aa  250  5e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 551 aa  250  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 577 aa  250  6e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 556 aa  249  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.13 
 
 		 518 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 517 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 566 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.11 
 
 		 514 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.3 
 
 		 522 aa  248  2e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 		 515 aa  248  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.78 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.78 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.78 
 
 		 517 aa  248  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 517 aa  248  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 662 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2377  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 530 aa  247  3e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581612  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 518 aa  247  4e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>